More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2291 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  49.49 
 
 
819 aa  760    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
851 aa  1689    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  54.76 
 
 
911 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  55.71 
 
 
814 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  42.73 
 
 
814 aa  363  7.0000000000000005e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  45.07 
 
 
718 aa  363  1e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  38.95 
 
 
838 aa  331  3e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  38.77 
 
 
845 aa  324  5e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  36.8 
 
 
875 aa  295  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  50.52 
 
 
623 aa  187  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  50 
 
 
750 aa  184  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  49.72 
 
 
398 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  48.15 
 
 
702 aa  161  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  47.74 
 
 
519 aa  160  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  38.89 
 
 
441 aa  159  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  45.65 
 
 
463 aa  155  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  43.56 
 
 
417 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.85 
 
 
488 aa  151  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  38.22 
 
 
705 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  37.59 
 
 
442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  44.92 
 
 
394 aa  147  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.85 
 
 
390 aa  146  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.08 
 
 
428 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.08 
 
 
428 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  41.18 
 
 
408 aa  142  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.78 
 
 
508 aa  141  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.21 
 
 
397 aa  140  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  48.23 
 
 
440 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  41.62 
 
 
770 aa  139  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  32.64 
 
 
383 aa  137  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  36.69 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  35.54 
 
 
410 aa  135  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.1 
 
 
454 aa  135  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  37.07 
 
 
399 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  37.9 
 
 
405 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.67 
 
 
462 aa  133  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  35.25 
 
 
419 aa  132  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  40.96 
 
 
475 aa  131  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  35.8 
 
 
451 aa  131  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.43 
 
 
584 aa  131  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.81 
 
 
562 aa  131  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  34.98 
 
 
419 aa  131  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.92 
 
 
636 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  31.87 
 
 
404 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  34.02 
 
 
408 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  38.66 
 
 
428 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  33.58 
 
 
804 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.03 
 
 
413 aa  127  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2049  hypothetical protein  35.8 
 
 
533 aa  126  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  45.07 
 
 
266 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  31.32 
 
 
425 aa  125  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.93 
 
 
415 aa  125  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 
428 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 
428 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 
428 aa  124  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  35.47 
 
 
399 aa  124  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  34.69 
 
 
405 aa  124  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  34.66 
 
 
442 aa  124  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  42.03 
 
 
264 aa  124  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  37.39 
 
 
401 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.33 
 
 
276 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.32 
 
 
545 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  37.02 
 
 
402 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  43.48 
 
 
265 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  42.29 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  32.92 
 
 
421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  37.02 
 
 
402 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  40.11 
 
 
479 aa  122  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  36.6 
 
 
398 aa  122  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  33.89 
 
 
401 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  34.02 
 
 
404 aa  122  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  33.89 
 
 
401 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  35.95 
 
 
401 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  33.89 
 
 
401 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  38.31 
 
 
564 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  40.23 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 
403 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  45.07 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  32.8 
 
 
402 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  32.8 
 
 
402 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 
403 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 
403 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  44.44 
 
 
462 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 
401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  46.38 
 
 
261 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  46.43 
 
 
265 aa  119  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 
403 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  35.97 
 
 
415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 
403 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  33.96 
 
 
637 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  32.8 
 
 
402 aa  119  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.82 
 
 
266 aa  119  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  32.17 
 
 
437 aa  119  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0008  flagellar hook protein  29.27 
 
 
546 aa  119  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.54 
 
 
260 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.22 
 
 
426 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  32.8 
 
 
402 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.6 
 
 
525 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.43 
 
 
430 aa  118  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.57 
 
 
261 aa  118  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>