More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2432 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 
562 aa  1138    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  51.32 
 
 
545 aa  551  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  47.21 
 
 
564 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  48.81 
 
 
527 aa  485  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.83 
 
 
513 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.75 
 
 
525 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.72 
 
 
501 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  36.62 
 
 
501 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  37.32 
 
 
498 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.28 
 
 
808 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.03 
 
 
499 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  34.14 
 
 
496 aa  231  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.97 
 
 
508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.66 
 
 
488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  30.16 
 
 
462 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  30.45 
 
 
462 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  29.48 
 
 
442 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  37.54 
 
 
419 aa  171  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  37.33 
 
 
419 aa  166  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  27.77 
 
 
413 aa  156  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  38.27 
 
 
413 aa  153  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  34.8 
 
 
433 aa  144  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.03 
 
 
428 aa  140  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.03 
 
 
428 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  26.83 
 
 
461 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  33.84 
 
 
428 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  32.36 
 
 
819 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  37.96 
 
 
417 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  49.64 
 
 
814 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  45.81 
 
 
851 aa  131  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  31.49 
 
 
911 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  37.61 
 
 
441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  52.85 
 
 
519 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.51 
 
 
294 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0335903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.52 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3580  hypothetical protein  37.19 
 
 
565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.304343  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  49.62 
 
 
266 aa  122  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  34.62 
 
 
440 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3829  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.59 
 
 
294 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  30.82 
 
 
450 aa  120  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.92 
 
 
413 aa  120  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  37.77 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  30.65 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  33.87 
 
 
463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  34.89 
 
 
461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  35.93 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  33.76 
 
 
440 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  49.22 
 
 
856 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.99 
 
 
636 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  38.7 
 
 
398 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  35.57 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  43.8 
 
 
718 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  50.41 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  35.57 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  49.6 
 
 
263 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  43.31 
 
 
441 aa  115  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  34.18 
 
 
420 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  45.59 
 
 
845 aa  114  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  45 
 
 
442 aa  114  5e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  46.81 
 
 
875 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3435  hypothetical protein  47.66 
 
 
259 aa  113  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.93 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  33.77 
 
 
405 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  45.59 
 
 
838 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.1 
 
 
276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  35.47 
 
 
443 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  44.85 
 
 
394 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  34.04 
 
 
458 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  32.71 
 
 
413 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1480  flagellar hook protein FlgE  32.64 
 
 
554 aa  111  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  34.33 
 
 
414 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  34.33 
 
 
414 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  34.33 
 
 
414 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  38.18 
 
 
440 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  32.71 
 
 
413 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  32.71 
 
 
413 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  32.71 
 
 
413 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  40.11 
 
 
804 aa  110  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  32.71 
 
 
413 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  32.71 
 
 
413 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  32.71 
 
 
413 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  33.76 
 
 
413 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3295  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.79 
 
 
296 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.91 
 
 
397 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  33.59 
 
 
459 aa  110  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  49.19 
 
 
454 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  37.63 
 
 
814 aa  109  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  34.76 
 
 
454 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  41.94 
 
 
401 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  41.94 
 
 
402 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  41.94 
 
 
402 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  47.06 
 
 
408 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  41.94 
 
 
402 aa  109  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  41.94 
 
 
402 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  41.94 
 
 
401 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  44 
 
 
399 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  41.94 
 
 
401 aa  109  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  41.94 
 
 
401 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  39.33 
 
 
770 aa  108  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  32.09 
 
 
408 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>