More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1862 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
814 aa  1643    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  80.9 
 
 
819 aa  1293    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  44.02 
 
 
814 aa  648    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  43.71 
 
 
845 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  43.27 
 
 
838 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  55.48 
 
 
911 aa  472  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  54.86 
 
 
851 aa  438  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  50.91 
 
 
875 aa  333  7.000000000000001e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  48.39 
 
 
718 aa  306  7e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  51.61 
 
 
623 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  51.08 
 
 
750 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  50.28 
 
 
398 aa  167  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  49.5 
 
 
519 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  46.97 
 
 
441 aa  157  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  47.09 
 
 
702 aa  156  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  48.33 
 
 
462 aa  155  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  45.77 
 
 
417 aa  154  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  39.68 
 
 
417 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  48.63 
 
 
463 aa  152  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.45 
 
 
488 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.68 
 
 
636 aa  149  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.57 
 
 
390 aa  147  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.01 
 
 
428 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.01 
 
 
428 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  36.44 
 
 
394 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  38.2 
 
 
399 aa  144  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  35.68 
 
 
383 aa  143  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.5 
 
 
508 aa  143  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  38.93 
 
 
401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  45.36 
 
 
442 aa  142  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  38.93 
 
 
401 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  38.93 
 
 
401 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  44.09 
 
 
705 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  34.55 
 
 
401 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  39.33 
 
 
402 aa  141  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  39.33 
 
 
402 aa  141  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  42.71 
 
 
440 aa  140  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.91 
 
 
454 aa  140  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  45.16 
 
 
479 aa  140  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  39.33 
 
 
402 aa  139  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  41.99 
 
 
408 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  34.43 
 
 
475 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  39.33 
 
 
402 aa  138  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  33.62 
 
 
405 aa  137  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  43.01 
 
 
770 aa  136  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  36.97 
 
 
405 aa  135  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  34.3 
 
 
410 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.41 
 
 
584 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  31.45 
 
 
451 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  32.75 
 
 
405 aa  134  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  33 
 
 
419 aa  134  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  37.4 
 
 
428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.8 
 
 
525 aa  132  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  49.64 
 
 
562 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  35.34 
 
 
415 aa  130  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2049  hypothetical protein  35.25 
 
 
533 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  34.54 
 
 
405 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  31.92 
 
 
433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  31.86 
 
 
419 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  51.82 
 
 
856 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.46 
 
 
397 aa  128  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  37.21 
 
 
409 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  36.18 
 
 
403 aa  128  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  36.18 
 
 
403 aa  128  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  36.18 
 
 
403 aa  128  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  36.18 
 
 
403 aa  128  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  49.33 
 
 
266 aa  127  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  36.18 
 
 
403 aa  128  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  34.57 
 
 
404 aa  127  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  35.37 
 
 
404 aa  126  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.62 
 
 
415 aa  126  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  31.04 
 
 
442 aa  125  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  33.11 
 
 
501 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  36.59 
 
 
408 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  31.4 
 
 
404 aa  125  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  31.92 
 
 
437 aa  125  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.82 
 
 
276 aa  125  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.93 
 
 
513 aa  124  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 
428 aa  124  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 
428 aa  124  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 
428 aa  124  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  30.43 
 
 
498 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  31.54 
 
 
437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  32.37 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  34.02 
 
 
401 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  44.93 
 
 
265 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  46.24 
 
 
260 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  44.2 
 
 
264 aa  121  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  44.53 
 
 
564 aa  121  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  35.66 
 
 
413 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  34.85 
 
 
402 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  34.85 
 
 
402 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  34.54 
 
 
615 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  34.17 
 
 
401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  32.72 
 
 
804 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.2 
 
 
808 aa  119  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.3 
 
 
261 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.61 
 
 
430 aa  118  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  31.3 
 
 
437 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  32.91 
 
 
407 aa  117  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>