More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0032 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
718 aa  1437    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  40.71 
 
 
814 aa  520  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  39.42 
 
 
838 aa  485  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  45.05 
 
 
851 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  43.76 
 
 
911 aa  314  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  45.33 
 
 
819 aa  310  4e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  49.69 
 
 
814 aa  301  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  42.97 
 
 
845 aa  267  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  43.43 
 
 
875 aa  265  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  50.53 
 
 
623 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  50.53 
 
 
750 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  49.72 
 
 
398 aa  172  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  39.38 
 
 
441 aa  163  9e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  47.83 
 
 
463 aa  162  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  38.97 
 
 
408 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  45.7 
 
 
702 aa  151  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  51.43 
 
 
417 aa  150  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  45.9 
 
 
519 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  43.16 
 
 
705 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  45.99 
 
 
394 aa  146  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  39.91 
 
 
442 aa  146  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  50.35 
 
 
440 aa  145  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.41 
 
 
508 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  36.65 
 
 
804 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.36 
 
 
488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  42.63 
 
 
770 aa  141  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.87 
 
 
415 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.32 
 
 
390 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.28 
 
 
462 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.86 
 
 
397 aa  137  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.78 
 
 
454 aa  137  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  31.85 
 
 
405 aa  136  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  36.36 
 
 
428 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  36.36 
 
 
428 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  36.36 
 
 
428 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.79 
 
 
636 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.64 
 
 
276 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  34.24 
 
 
399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  40 
 
 
475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  34.57 
 
 
419 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  36.82 
 
 
408 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  36.36 
 
 
398 aa  131  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  34.84 
 
 
419 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  33.94 
 
 
401 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  29.86 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 
401 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  37.36 
 
 
401 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3830  hypothetical protein  35.74 
 
 
538 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0390801  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  31.2 
 
 
399 aa  128  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  35.11 
 
 
401 aa  127  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.98 
 
 
428 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.98 
 
 
428 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  31.18 
 
 
442 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  35.36 
 
 
402 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  35.36 
 
 
402 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  31.54 
 
 
383 aa  126  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  37.13 
 
 
401 aa  126  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.41 
 
 
584 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  37.13 
 
 
401 aa  126  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  38.78 
 
 
564 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  37.39 
 
 
402 aa  125  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  33.75 
 
 
410 aa  125  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  36.02 
 
 
440 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.86 
 
 
426 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  46.06 
 
 
856 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.26 
 
 
426 aa  124  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  34.18 
 
 
402 aa  124  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  34.18 
 
 
402 aa  124  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.51 
 
 
423 aa  123  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  37.39 
 
 
402 aa  123  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 
415 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  33.13 
 
 
405 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  31.47 
 
 
425 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  42.75 
 
 
264 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  33.45 
 
 
405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  40.32 
 
 
479 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.86 
 
 
501 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3103  flagellar basal body FlaE domain protein  42.14 
 
 
531 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178988  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  34.58 
 
 
417 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  43.61 
 
 
265 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
451 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  32.36 
 
 
462 aa  120  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  34.87 
 
 
404 aa  120  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2290  fagellar hook-basal body protein  34.4 
 
 
567 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  34.47 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  31.82 
 
 
462 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  34.8 
 
 
405 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  31.49 
 
 
414 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  33.85 
 
 
403 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  33.85 
 
 
403 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  33.01 
 
 
407 aa  119  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  26.82 
 
 
404 aa  118  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0008  flagellar hook protein  32.8 
 
 
546 aa  119  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  33.46 
 
 
437 aa  118  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  43.66 
 
 
266 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  30.64 
 
 
404 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2049  hypothetical protein  33.73 
 
 
533 aa  118  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>