More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3570 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  997    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  37.62 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.22 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.02 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  35.74 
 
 		 419 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  35.66 
 
 		 413 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  35.21 
 
 		 419 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  32.83 
 
 		 564 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  35.48 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.31 
 
 		 562 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.39 
 
 		 525 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.99 
 
 		 545 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.88 
 
 		 488 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  33.2 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  31.24 
 
 		 527 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.49 
 
 		 513 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  32.03 
 
 		 460 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  34 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  32.65 
 
 		 408 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  32.79 
 
 		 440 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  32.29 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  33.2 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 453 aa  199  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  33.6 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  32.13 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  31.42 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  31.72 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  30.51 
 
 		 451 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  31.9 
 
 		 440 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  31.89 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  31.73 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  30.38 
 
 		 475 aa  195  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  30.58 
 
 		 405 aa  194  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.74 
 
 		 423 aa  193  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  30.78 
 
 		 498 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.6 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  30.13 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  31.13 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  31.13 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  31.13 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  31.34 
 
 		 453 aa  190  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  32.85 
 
 		 409 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.96 
 
 		 501 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  31.8 
 
 		 438 aa  189  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  32.22 
 
 		 455 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  31.79 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.11 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  30.65 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  30.65 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  30.65 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  29.63 
 
 		 454 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  30.52 
 
 		 453 aa  186  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  30.31 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  31.82 
 
 		 407 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.11 
 
 		 499 aa  183  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 		 406 aa  183  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  32.03 
 
 		 459 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  30.74 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  30.94 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.21 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  30.72 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  31.12 
 
 		 437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  30.57 
 
 		 413 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  30.1 
 
 		 413 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  29.05 
 
 		 401 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  29.41 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  30.52 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  29.35 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  29.46 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  30.99 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  29.19 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  28.41 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  30.06 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  28.99 
 
 		 462 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  29.42 
 
 		 414 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  30.65 
 
 		 442 aa  176  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  29.03 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  29.03 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  29.03 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  29.63 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  29.63 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  29.63 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  29.63 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  29.63 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  29.63 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  29.63 
 
 		 413 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.81 
 
 		 418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  30.52 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  30.93 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  30.74 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  30.36 
 
 		 437 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  31.17 
 
 		 425 aa  174  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  30.11 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  30.11 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3830  hypothetical protein  30.48 
 
 		 538 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0390801  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  29.81 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  31.08 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.03 
 
 		 415 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  29.38 
 
 		 441 aa  170  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  29.69 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>