More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1636 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  100 
 
 
564 aa  1146    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  66.14 
 
 
545 aa  721    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  61.45 
 
 
527 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.95 
 
 
562 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.49 
 
 
525 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.65 
 
 
513 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.3 
 
 
501 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  39.4 
 
 
501 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  40.64 
 
 
498 aa  352  7e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.54 
 
 
808 aa  323  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.37 
 
 
499 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  32.83 
 
 
496 aa  235  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  33.68 
 
 
519 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  31.29 
 
 
463 aa  219  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.61 
 
 
488 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  31.53 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  37.7 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1471  hypothetical protein  26.77 
 
 
538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  27.65 
 
 
443 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  28.5 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  36.64 
 
 
419 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  27.55 
 
 
425 aa  160  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  34.9 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  28.25 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  36.5 
 
 
433 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3829  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.76 
 
 
294 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.1 
 
 
428 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.1 
 
 
428 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  38.78 
 
 
718 aa  126  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3435  hypothetical protein  50.74 
 
 
259 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  39.9 
 
 
266 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  46.43 
 
 
475 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.27 
 
 
294 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0335903 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.7 
 
 
413 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.03 
 
 
508 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  49.28 
 
 
454 aa  124  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  32.92 
 
 
428 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  35.95 
 
 
398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  44.53 
 
 
819 aa  121  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 
851 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  44.53 
 
 
814 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  45.32 
 
 
911 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  36.92 
 
 
442 aa  120  6e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  48.57 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  36.44 
 
 
814 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  45.03 
 
 
838 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  44.37 
 
 
845 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  49.26 
 
 
417 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1480  flagellar hook protein FlgE  32.34 
 
 
554 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  33.55 
 
 
441 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  35.09 
 
 
440 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.48 
 
 
636 aa  117  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2335  flagellar hook protein FlgE  24.73 
 
 
432 aa  117  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  44.37 
 
 
875 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.32 
 
 
462 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  30.72 
 
 
460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  24.91 
 
 
474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  34.51 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.73 
 
 
584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  26.81 
 
 
460 aa  115  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3295  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.45 
 
 
296 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  32.96 
 
 
462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  32.95 
 
 
453 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  32.95 
 
 
453 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  24.96 
 
 
465 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  24.96 
 
 
465 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  32.95 
 
 
453 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  32.95 
 
 
453 aa  113  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  32.49 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  29.73 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  31.56 
 
 
442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  45.99 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.45 
 
 
266 aa  111  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  45.8 
 
 
856 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  43.97 
 
 
440 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  33.61 
 
 
451 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  31.17 
 
 
407 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  31.17 
 
 
407 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  32.34 
 
 
459 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.85 
 
 
390 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  30.51 
 
 
450 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  37.71 
 
 
261 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.38 
 
 
397 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  47.79 
 
 
408 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.38 
 
 
415 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.33 
 
 
276 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  31.06 
 
 
453 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  31.06 
 
 
453 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  35.07 
 
 
705 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  31.06 
 
 
453 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  40.29 
 
 
405 aa  107  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0546  hypothetical protein  30.2 
 
 
661 aa  107  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  31.6 
 
 
458 aa  107  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4204  hypothetical protein  39.33 
 
 
294 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  31.56 
 
 
440 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  44.68 
 
 
275 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  48.41 
 
 
263 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  35.67 
 
 
401 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  28.39 
 
 
423 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  32.08 
 
 
454 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>