More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1638 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 
413 aa  833    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  37.32 
 
 
413 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.15 
 
 
428 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.89 
 
 
428 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 
405 aa  239  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  36.28 
 
 
419 aa  239  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  37.8 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  35.35 
 
 
419 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  34.86 
 
 
410 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  36 
 
 
413 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  35.17 
 
 
399 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  34.99 
 
 
428 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  37.09 
 
 
414 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  35.41 
 
 
442 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  36.84 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  35.42 
 
 
407 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  34.68 
 
 
428 aa  219  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  34.68 
 
 
428 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  34.68 
 
 
428 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  36.47 
 
 
413 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 
413 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  35.44 
 
 
383 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 
413 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  34.47 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  35.06 
 
 
413 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  35.76 
 
 
413 aa  216  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  35.87 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  36.11 
 
 
417 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  35.42 
 
 
404 aa  212  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  34.2 
 
 
408 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  33.48 
 
 
440 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.27 
 
 
423 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.65 
 
 
430 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  33.49 
 
 
420 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  34.84 
 
 
408 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  34.91 
 
 
413 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  34.91 
 
 
413 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  34.91 
 
 
413 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  34.91 
 
 
413 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  34.91 
 
 
413 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  34.91 
 
 
413 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  34.91 
 
 
413 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  31.52 
 
 
450 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  34.98 
 
 
403 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  34.98 
 
 
403 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  32.57 
 
 
417 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  34.98 
 
 
403 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  34.98 
 
 
403 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  34.98 
 
 
403 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  34.82 
 
 
410 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  34.82 
 
 
413 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  34.51 
 
 
414 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  34.51 
 
 
414 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  34.51 
 
 
414 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
402 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
402 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.61 
 
 
395 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  36.06 
 
 
395 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  34.03 
 
 
405 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  34.69 
 
 
402 aa  206  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  34.12 
 
 
401 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  35.05 
 
 
418 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.41 
 
 
454 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.02 
 
 
397 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  33.89 
 
 
401 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  34.62 
 
 
401 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  34.2 
 
 
405 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.5 
 
 
400 aa  203  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  36.5 
 
 
400 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.53 
 
 
488 aa  202  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  33.65 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  33.65 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  33.8 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  32.71 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  35.82 
 
 
395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.64 
 
 
418 aa  199  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  34.52 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  32.47 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  33.72 
 
 
398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  33.92 
 
 
442 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  29.84 
 
 
442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  34.2 
 
 
394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 
398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 
437 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  34.21 
 
 
399 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  31.49 
 
 
425 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 
441 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  32.24 
 
 
404 aa  193  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  34.88 
 
 
415 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  34.3 
 
 
438 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.43 
 
 
390 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  30.6 
 
 
496 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 
407 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  30 
 
 
463 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 
407 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  32.03 
 
 
453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>