More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2042 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 454 aa  910    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  62.36 
 
 		 440 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.13 
 
 		 488 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  45.53 
 
 		 417 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  41.72 
 
 		 475 aa  315  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  40 
 
 		 463 aa  286  7e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  40.76 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  40.25 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.74 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  38.82 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.2 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  38.83 
 
 		 479 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  39.35 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  38.88 
 
 		 398 aa  264  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.3 
 
 		 397 aa  260  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.04 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  37.93 
 
 		 419 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.22 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  34.49 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  35.78 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  36.18 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  33.47 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  34.73 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.41 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.12 
 
 		 428 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.9 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  34.71 
 
 		 403 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  34.49 
 
 		 403 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  34.37 
 
 		 401 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  32.2 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  34.49 
 
 		 403 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  34.71 
 
 		 403 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  34.71 
 
 		 403 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  32.59 
 
 		 401 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  33.97 
 
 		 428 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  34.07 
 
 		 404 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  33.97 
 
 		 428 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  33.97 
 
 		 428 aa  192  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  33.19 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  33.19 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  33.92 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  32.11 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  33.48 
 
 		 414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  33.48 
 
 		 414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.35 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  34.06 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  34.06 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  33.92 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  34.06 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  32.11 
 
 		 496 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  34.77 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  33.91 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  33.91 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  33.91 
 
 		 401 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  33.84 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  31.18 
 
 		 428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  32.01 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  34.21 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 		 407 aa  184  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  33.19 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  31.28 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  32.46 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  32.74 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  32.75 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  32.75 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  32.75 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  32.75 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  32.75 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  32.75 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  32.75 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  33.7 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  34.14 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.45 
 
 		 501 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  31.93 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  33.77 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  32.55 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.44 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.08 
 
 		 513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  32.26 
 
 		 442 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  32.04 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  32.82 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  32.82 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  41.11 
 
 		 750 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  41.11 
 
 		 623 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.55 
 
 		 426 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  31.36 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  30.6 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  31.48 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 		 413 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  31.63 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  32.47 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  29.9 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  28.62 
 
 		 501 aa  166  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  30.17 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  30.68 
 
 		 399 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  30.7 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>