More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3913 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 
294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0335903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3829  protein of unknown function DUF1078 domain protein  90.48 
 
 
294 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4204  hypothetical protein  71.43 
 
 
294 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3295  protein of unknown function DUF1078 domain protein  51.32 
 
 
296 aa  257  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3435  hypothetical protein  48.64 
 
 
259 aa  239  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  37.17 
 
 
275 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  34.81 
 
 
266 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  59.7 
 
 
419 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  59.4 
 
 
419 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.43 
 
 
263 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  31.89 
 
 
264 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.88 
 
 
276 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  31.27 
 
 
310 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  46.27 
 
 
564 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0414  hypothetical protein  31.89 
 
 
312 aa  126  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  32.56 
 
 
271 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.27 
 
 
545 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.49 
 
 
266 aa  122  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.87 
 
 
562 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  31.17 
 
 
266 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  44.12 
 
 
413 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0050  fagellar hook-basal body protein  31.45 
 
 
293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.92 
 
 
261 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  32.01 
 
 
262 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  30.97 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  31.31 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.72 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  29.18 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  31.46 
 
 
262 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  31.13 
 
 
262 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  27.5 
 
 
394 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  46.31 
 
 
433 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  31.6 
 
 
262 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  31.6 
 
 
262 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  31.6 
 
 
262 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  31.6 
 
 
262 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  31.6 
 
 
262 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  31.6 
 
 
262 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  31.6 
 
 
262 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2910  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.44 
 
 
275 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112193  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2386  hypothetical protein  30.59 
 
 
266 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.54 
 
 
808 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4123  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.96 
 
 
329 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  28.85 
 
 
261 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  30.9 
 
 
262 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  30.19 
 
 
280 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  30.62 
 
 
262 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  30.56 
 
 
262 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  30.07 
 
 
260 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  29.93 
 
 
260 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  31.15 
 
 
262 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.02 
 
 
260 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.02 
 
 
260 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  28.9 
 
 
265 aa  105  8e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  28.81 
 
 
262 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  30.85 
 
 
261 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  30.85 
 
 
261 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  31.7 
 
 
262 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.36 
 
 
262 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  32.77 
 
 
261 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  29.64 
 
 
266 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.56 
 
 
260 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.22 
 
 
264 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  31.35 
 
 
260 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.62 
 
 
261 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  30.03 
 
 
262 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  30.46 
 
 
260 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  30.69 
 
 
260 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  30.69 
 
 
260 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.56 
 
 
260 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  30.46 
 
 
260 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  30.51 
 
 
260 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  29.8 
 
 
260 aa  102  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  30.46 
 
 
260 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.81 
 
 
261 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  31.02 
 
 
262 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.7 
 
 
260 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  30.27 
 
 
261 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  46.49 
 
 
527 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  29.61 
 
 
262 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  31.02 
 
 
262 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  31.02 
 
 
262 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  30.13 
 
 
260 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.13 
 
 
260 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.46 
 
 
262 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  36.31 
 
 
442 aa  100  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  32.35 
 
 
262 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  39.01 
 
 
428 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.72 
 
 
428 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  30.13 
 
 
260 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  30.13 
 
 
260 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.72 
 
 
428 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  30.13 
 
 
260 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  30.13 
 
 
260 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3689  hypothetical protein  30.41 
 
 
263 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  29.83 
 
 
260 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.05 
 
 
263 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.24 
 
 
260 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.98 
 
 
261 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>