More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2910 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2910  protein of unknown function DUF1078-like protein  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  55.42 
 
 		 435 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3244  flagellar basal body rod protein FlgG  35.61 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1345  flagellar basal body rod protein FlgG  35.61 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1350  flagellar basal body rod protein FlgG  35.61 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1264  flagellar basal body rod protein FlgG  35.25 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1334  flagellar basal body rod protein FlgG  35.25 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2592  flagellar basal body rod protein FlgG  34.89 
 
 		 262 aa  142  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  35.25 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.898516  normal  0.0829972 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.96 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.96 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  34.89 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  33.45 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1421  flagellar basal body rod protein FlgG  34.89 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1602  flagellar basal body rod protein FlgG  34.53 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2942  flagellar basal body rod protein FlgG  34.89 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.28 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2957  flagellar basal body rod protein FlgG  34.53 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.711703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  34.3 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.57 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2313  flagellar basal body rod protein FlgG  34.3 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3082  flagellar basal body rod protein FlgG  34.17 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  44.05 
 
 		 418 aa  135  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  30 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.12 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.73 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  32.51 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  31.56 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.37 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.37 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.99 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  33.33 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  31.12 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  31.36 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.18 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0515  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.07 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1166  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.49 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  31.65 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  31.01 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2333  flagellar basal body rod protein FlgG  32.01 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  31.72 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.22 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.94 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.65 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  31.47 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.56 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0797  flagellar basal body rod protein FlgG  33.21 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0866947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0721  flagellar basal body rod protein FlgG  33.21 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000178578  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.98 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2912  flagellar basal body rod protein FlgG  32.16 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3366  flagellar basal body rod protein FlgG  30.5 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  30.39 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02923  flagellar basal body rod protein FlgG  31.1 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  31.56 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2703  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.87 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0268  flagellar basal body rod protein FlgG  30.5 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.56 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  31.65 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  33.1 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  31.65 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  39.63 
 
 		 425 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  32.85 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000584839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  32.28 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.62 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.62 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1787  flagellar basal body rod protein FlgG  30.58 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  31.8 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  29.72 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  32.86 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.45 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  42.17 
 
 		 418 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.65 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.27 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.01 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.53 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  32.38 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  41.94 
 
 		 453 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  31.29 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  30.31 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.97 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.36 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.94 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.6 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  31.65 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  30.5 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  30.5 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  30.85 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  32.28 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  30.85 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  32.28 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  30 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  31.91 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  38.46 
 
 		 453 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  30.94 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  31.29 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.47 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004168  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.86 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.22 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  30.31 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.755764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>