More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2208 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  100 
 
 
261 aa  520  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  71.26 
 
 
261 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  68.58 
 
 
261 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  68.58 
 
 
261 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  67.82 
 
 
261 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  66.67 
 
 
261 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  68.7 
 
 
262 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  68.32 
 
 
262 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  67.05 
 
 
261 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  67.43 
 
 
261 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  66.67 
 
 
261 aa  361  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  66.67 
 
 
262 aa  355  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  61.3 
 
 
261 aa  331  6e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  62.16 
 
 
260 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  60.15 
 
 
262 aa  323  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  59.39 
 
 
261 aa  324  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  60.23 
 
 
260 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  61.78 
 
 
260 aa  322  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  58.62 
 
 
263 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  57.85 
 
 
261 aa  317  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  58.62 
 
 
261 aa  317  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  58.75 
 
 
262 aa  315  6e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  58.24 
 
 
261 aa  314  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02923  flagellar basal body rod protein FlgG  58.4 
 
 
262 aa  313  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  57.85 
 
 
261 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  58.24 
 
 
261 aa  311  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  60.62 
 
 
262 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  57.47 
 
 
261 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  57.47 
 
 
261 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  60.62 
 
 
262 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  60.62 
 
 
262 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  60.62 
 
 
262 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  60.62 
 
 
262 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  60.62 
 
 
262 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  60.62 
 
 
262 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  58.3 
 
 
260 aa  308  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0242  flagellar basal body rod protein FlgG  56.37 
 
 
262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0189  flagellar basal body rod protein FlgG  56.37 
 
 
262 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  59.07 
 
 
260 aa  307  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  59.07 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  59.07 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  59.07 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  59.46 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  59.46 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  59.46 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  59.46 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  60.23 
 
 
262 aa  305  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  59.85 
 
 
262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  57.47 
 
 
261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  57.47 
 
 
261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  59.07 
 
 
262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  59.07 
 
 
262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.56 
 
 
261 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  59.07 
 
 
260 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  59.07 
 
 
260 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  59.07 
 
 
260 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  59.07 
 
 
260 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  59.07 
 
 
260 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  59.07 
 
 
260 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  59.46 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  58.69 
 
 
260 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  59.46 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01292  flagellar basal body rod protein FlgG  56.87 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.56 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  58.69 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  59.07 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  58.69 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  56.49 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  57.92 
 
 
260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  59.07 
 
 
260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  58.69 
 
 
262 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  58.69 
 
 
262 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  58.3 
 
 
262 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  57.92 
 
 
260 aa  301  9e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  58.3 
 
 
262 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  57.53 
 
 
260 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  58.3 
 
 
260 aa  299  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0515  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.26 
 
 
261 aa  299  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  55.98 
 
 
260 aa  298  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  57.92 
 
 
260 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  57.92 
 
 
260 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1787  flagellar basal body rod protein FlgG  55.73 
 
 
262 aa  297  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  55.94 
 
 
261 aa  297  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004168  flagellar basal-body rod protein FlgG  56.11 
 
 
262 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  57.92 
 
 
260 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.21 
 
 
260 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.21 
 
 
260 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.98 
 
 
261 aa  296  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2965  flagellar basal body rod protein FlgG  57.92 
 
 
260 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22311  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.44 
 
 
260 aa  295  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  54.96 
 
 
262 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  54.02 
 
 
261 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  54.02 
 
 
261 aa  293  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1421  flagellar basal body rod protein FlgG  54.58 
 
 
262 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2942  flagellar basal body rod protein FlgG  54.58 
 
 
262 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1166  flagellar basal body rod protein FlgG  54.96 
 
 
262 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2957  flagellar basal body rod protein FlgG  54.2 
 
 
262 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.711703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2313  flagellar basal body rod protein FlgG  54.2 
 
 
262 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1350  flagellar basal body rod protein FlgG  54.58 
 
 
262 aa  292  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  57.92 
 
 
260 aa  292  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>