More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0078 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  96.18 
 
 
262 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  60.47 
 
 
261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  56.98 
 
 
263 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.26 
 
 
261 aa  294  8e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  55.73 
 
 
262 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  58.14 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  58.14 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.83 
 
 
262 aa  285  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.65 
 
 
262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  56.98 
 
 
261 aa  281  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0515  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.55 
 
 
261 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308837  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  56.47 
 
 
260 aa  279  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.33 
 
 
260 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.33 
 
 
260 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  54.9 
 
 
262 aa  275  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  54.9 
 
 
262 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.9 
 
 
260 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  55.56 
 
 
262 aa  275  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  54.37 
 
 
262 aa  275  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.9 
 
 
260 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2912  flagellar basal body rod protein FlgG  56.11 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.157817  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  55.16 
 
 
262 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  55.16 
 
 
262 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  55.16 
 
 
262 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  55.16 
 
 
262 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  55.16 
 
 
262 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  55.16 
 
 
262 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  55.16 
 
 
262 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.16 
 
 
260 aa  271  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  54.51 
 
 
260 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  53.57 
 
 
262 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  54.51 
 
 
260 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  53.57 
 
 
262 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  53.97 
 
 
262 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  53.97 
 
 
262 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  55.29 
 
 
260 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2965  flagellar basal body rod protein FlgG  54.9 
 
 
260 aa  269  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22311  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  53.57 
 
 
262 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2313  flagellar basal body rod protein FlgG  51.35 
 
 
262 aa  269  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  53.73 
 
 
262 aa  268  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  54.9 
 
 
260 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1345  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 
262 aa  265  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  53.33 
 
 
260 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1959  flagellar basal-body rod FlgG  53.91 
 
 
261 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1334  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 
262 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  52.78 
 
 
262 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1421  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 
262 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2942  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 
262 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  53.33 
 
 
260 aa  263  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1350  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 
262 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3244  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 
262 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2957  flagellar basal body rod protein FlgG  50.19 
 
 
262 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.711703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  50.19 
 
 
262 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1264  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 
262 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 
262 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.898516  normal  0.0829972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  50.19 
 
 
262 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3082  flagellar basal body rod protein FlgG  49.81 
 
 
262 aa  262  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  52.16 
 
 
260 aa  261  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  50.39 
 
 
261 aa  261  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  50.39 
 
 
261 aa  261  6e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.16 
 
 
260 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  52.94 
 
 
260 aa  261  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  51.76 
 
 
260 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  51.76 
 
 
260 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  51.76 
 
 
260 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  51.76 
 
 
260 aa  261  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  50.78 
 
 
261 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  51.76 
 
 
260 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.76 
 
 
260 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.22 
 
 
261 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2592  flagellar basal body rod protein FlgG  50.19 
 
 
262 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  51.76 
 
 
260 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  51.76 
 
 
260 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  51.76 
 
 
260 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  51.76 
 
 
260 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.41 
 
 
261 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  51.37 
 
 
260 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  51.37 
 
 
260 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004168  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.97 
 
 
262 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  52.94 
 
 
261 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1166  flagellar basal body rod protein FlgG  50.19 
 
 
262 aa  259  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.02 
 
 
262 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1602  flagellar basal body rod protein FlgG  50.19 
 
 
262 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  51.37 
 
 
260 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  51.37 
 
 
260 aa  258  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  51.37 
 
 
260 aa  257  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
261 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 
261 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1482  flagellar basal body rod protein FlgG  49.03 
 
 
262 aa  256  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.655215  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  52.55 
 
 
261 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  50.39 
 
 
261 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1787  flagellar basal body rod protein FlgG  51.35 
 
 
262 aa  256  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.97 
 
 
260 aa  255  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  48.84 
 
 
262 aa  255  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01292  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 
262 aa  255  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  50 
 
 
260 aa  254  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2333  flagellar basal body rod protein FlgG  49.42 
 
 
262 aa  254  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.59 
 
 
261 aa  254  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>