More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004168 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004168  flagellar basal-body rod protein FlgG  100 
 
 
262 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01292  flagellar basal body rod protein FlgG  98.09 
 
 
262 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2333  flagellar basal body rod protein FlgG  85.11 
 
 
262 aa  474  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1787  flagellar basal body rod protein FlgG  85.88 
 
 
262 aa  475  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2592  flagellar basal body rod protein FlgG  69.08 
 
 
262 aa  381  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3244  flagellar basal body rod protein FlgG  68.7 
 
 
262 aa  377  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1350  flagellar basal body rod protein FlgG  69.08 
 
 
262 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1602  flagellar basal body rod protein FlgG  69.08 
 
 
262 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1345  flagellar basal body rod protein FlgG  68.7 
 
 
262 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1421  flagellar basal body rod protein FlgG  69.47 
 
 
262 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2957  flagellar basal body rod protein FlgG  69.08 
 
 
262 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.711703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  69.47 
 
 
262 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02923  flagellar basal body rod protein FlgG  68.7 
 
 
262 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1264  flagellar basal body rod protein FlgG  68.7 
 
 
262 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1334  flagellar basal body rod protein FlgG  69.08 
 
 
262 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  69.47 
 
 
262 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.898516  normal  0.0829972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2313  flagellar basal body rod protein FlgG  68.7 
 
 
262 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2942  flagellar basal body rod protein FlgG  69.47 
 
 
262 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1482  flagellar basal body rod protein FlgG  66.79 
 
 
262 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.655215  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  68.7 
 
 
262 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3082  flagellar basal body rod protein FlgG  68.7 
 
 
262 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1166  flagellar basal body rod protein FlgG  67.56 
 
 
262 aa  371  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  66.03 
 
 
262 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  61.83 
 
 
263 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  59.16 
 
 
261 aa  318  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  60.31 
 
 
261 aa  314  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  60.31 
 
 
261 aa  314  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  56.11 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  59.92 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  57.75 
 
 
262 aa  308  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  57.63 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  58.02 
 
 
261 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0515  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.58 
 
 
261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  57.63 
 
 
261 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  56.87 
 
 
261 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  56.87 
 
 
261 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.44 
 
 
262 aa  298  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  56.11 
 
 
261 aa  297  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  56.49 
 
 
261 aa  296  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  55.6 
 
 
261 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  55.6 
 
 
261 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  55.77 
 
 
260 aa  294  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  54.96 
 
 
261 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  54.96 
 
 
261 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  57.41 
 
 
262 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  55.38 
 
 
260 aa  293  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  57.03 
 
 
262 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  55 
 
 
260 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  55 
 
 
260 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  55.77 
 
 
260 aa  291  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  55.77 
 
 
260 aa  291  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2965  flagellar basal body rod protein FlgG  55.77 
 
 
260 aa  291  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22311  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  55.38 
 
 
260 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.92 
 
 
260 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  55.38 
 
 
260 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  55.38 
 
 
260 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  55.38 
 
 
260 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  55.38 
 
 
260 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.38 
 
 
260 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  55.38 
 
 
260 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  55.38 
 
 
260 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  55.38 
 
 
260 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  55.38 
 
 
260 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.31 
 
 
260 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.31 
 
 
260 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  55.38 
 
 
260 aa  288  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.44 
 
 
261 aa  288  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  53.46 
 
 
260 aa  288  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  55 
 
 
260 aa  288  9e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  54.23 
 
 
260 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.44 
 
 
261 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  56.98 
 
 
262 aa  285  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  55 
 
 
261 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3578  flagellar basal-body rod protein FlgG  57.63 
 
 
261 aa  285  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.08 
 
 
260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.91 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  54.96 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  53.85 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.05 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.09 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.46 
 
 
260 aa  281  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  53.82 
 
 
261 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1959  flagellar basal-body rod FlgG  54.02 
 
 
261 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  55 
 
 
260 aa  279  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  52.31 
 
 
262 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  51.92 
 
 
262 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.08 
 
 
260 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.08 
 
 
260 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.46 
 
 
260 aa  278  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.77 
 
 
260 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.31 
 
 
260 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.08 
 
 
260 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.62 
 
 
261 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  52.31 
 
 
262 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  50.77 
 
 
260 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  51.92 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1469  hypothetical protein  54.02 
 
 
263 aa  270  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  50.38 
 
 
260 aa  268  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  51.54 
 
 
262 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  51.54 
 
 
262 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>