More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2339 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 276 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  51.77 
 
 		 282 aa  268  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  49.28 
 
 		 265 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  47.84 
 
 		 264 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  46.1 
 
 		 275 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  44.6 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  58.7 
 
 		 408 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  57.39 
 
 		 398 aa  193  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.46 
 
 		 263 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0050  fagellar hook-basal body protein  40.48 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.28 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  40.89 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  55.98 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  63.64 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  60 
 
 		 390 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  40 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  38.35 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.71 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  38.85 
 
 		 266 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.99 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  40 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.07 
 
 		 266 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.07 
 
 		 266 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  37.86 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  38.13 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  37.18 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  40.57 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  39.15 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.15 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  35.97 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  35.84 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.63 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  38.97 
 
 		 261 aa  165  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  38.93 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  39.64 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  38.21 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  39.35 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.77 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  38.93 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  38.13 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1959  flagellar basal-body rod FlgG  39.21 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.43 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  36.46 
 
 		 261 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  52.5 
 
 		 462 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.55 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.23 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.23 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  35 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.23 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  37.91 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0515  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.77 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308837  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.01 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2703  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.28 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.36 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.81 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  38.81 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.92 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.35 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.82 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  37.28 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.18 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.35 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.17 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.05 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  36.33 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  36.33 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.09 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  35.9 
 
 		 261 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  37.92 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  36.69 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  37.09 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0414  hypothetical protein  35 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1345  flagellar basal body rod protein FlgG  37.5 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  37.28 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  37.05 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.92 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.92 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.56 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.96 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  36.4 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1097  flagellar basal body rod protein FlgG  37.5 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  37.05 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  37.27 
 
 		 262 aa  152  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  36.67 
 
 		 262 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.59 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  37.32 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.72 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  36.67 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1264  flagellar basal body rod protein FlgG  37.73 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  37.32 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.04 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  36.67 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1350  flagellar basal body rod protein FlgG  36.76 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>