More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4204 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4204  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  71.43 
 
 		 294 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0335903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3829  protein of unknown function DUF1078 domain protein  72.11 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3295  protein of unknown function DUF1078 domain protein  52.82 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3435  hypothetical protein  49.66 
 
 		 259 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  59.4 
 
 		 419 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  34.58 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  51.55 
 
 		 419 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.07 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  32.89 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  33.89 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  33.22 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.32 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  30.79 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  32.57 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0414  hypothetical protein  34.26 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  32.8 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0050  fagellar hook-basal body protein  31.31 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  30.69 
 
 		 266 aa  118  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.46 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.03 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  31.46 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  40.44 
 
 		 413 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  31.79 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.28 
 
 		 545 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.95 
 
 		 562 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  31.79 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  30.59 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  39.33 
 
 		 564 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.93 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.03 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  30.59 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  32.45 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.57 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  42.57 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  29.8 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  31.58 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  29.04 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  30.94 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  30.41 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  30.41 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1959  flagellar basal-body rod FlgG  30.46 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  28.05 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.04 
 
 		 808 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  30.26 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  28.48 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  30.79 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  29.14 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.14 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.14 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  29.51 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.51 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  29.51 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  29.51 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  29.51 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.55 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  29.87 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  29.51 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  29.87 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2386  hypothetical protein  28.29 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.1 
 
 		 263 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  29.47 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  28.48 
 
 		 262 aa  99  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.33 
 
 		 261 aa  99  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.13 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  29.18 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  29.18 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.61 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.72 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.15 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  31.13 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  28.3 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.72 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  26.73 
 
 		 261 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  29.74 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  29.74 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  30.13 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  29.51 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  29.74 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.29 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  29.74 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.02 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  29.74 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  29.32 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  29.55 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  32.12 
 
 		 261 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  28.81 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  28.85 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  28.85 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  28.85 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  31.18 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  28.9 
 
 		 262 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  28.9 
 
 		 262 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  28.9 
 
 		 262 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  30.56 
 
 		 266 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  28.9 
 
 		 262 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  27.7 
 
 		 261 aa  96.3  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  28.9 
 
 		 262 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  28.9 
 
 		 262 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  28.9 
 
 		 262 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>