More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0244 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  553  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.22 
 
 
267 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  44.85 
 
 
266 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  44.49 
 
 
266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.59 
 
 
270 aa  221  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  43.59 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  41.82 
 
 
262 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  41.91 
 
 
260 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.96 
 
 
260 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  42.65 
 
 
260 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  42.49 
 
 
260 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.76 
 
 
262 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  40.66 
 
 
265 aa  187  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  41.97 
 
 
264 aa  186  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  42.86 
 
 
261 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.66 
 
 
263 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  40.66 
 
 
262 aa  186  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.8 
 
 
262 aa  185  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.61 
 
 
262 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  41.39 
 
 
262 aa  185  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.93 
 
 
266 aa  185  8e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.8 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  41.18 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  40.37 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  41.13 
 
 
261 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  41.18 
 
 
261 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0797  flagellar basal body rod protein FlgG  40.15 
 
 
263 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0866947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.32 
 
 
262 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  42.32 
 
 
262 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  39.71 
 
 
262 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0721  flagellar basal body rod protein FlgG  40.15 
 
 
263 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000178578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.15 
 
 
264 aa  180  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.74 
 
 
260 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.27 
 
 
262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.74 
 
 
263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  40.15 
 
 
260 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  40.15 
 
 
261 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  39.63 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  41.54 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  41.48 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  39.78 
 
 
263 aa  178  7e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000584839  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  40 
 
 
260 aa  178  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4423  flagellar basal body rod protein FlgG  39.56 
 
 
262 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  40.52 
 
 
261 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  40.38 
 
 
261 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  38.1 
 
 
262 aa  178  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  40.07 
 
 
262 aa  177  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.81 
 
 
260 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  38.55 
 
 
262 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  40 
 
 
261 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.63 
 
 
260 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.44 
 
 
261 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.63 
 
 
260 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1156  flagellar basal body rod protein FlgG  41.54 
 
 
261 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  39.41 
 
 
261 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.18 
 
 
265 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  39.19 
 
 
262 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  41.95 
 
 
261 aa  175  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  38.6 
 
 
262 aa  175  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.27 
 
 
266 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.27 
 
 
266 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  39.63 
 
 
260 aa  175  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  40.81 
 
 
262 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.07 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  39.49 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  36.53 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.07 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  39.56 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  39.56 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  39.56 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  39.56 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  39.56 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.29 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  39.56 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  39.56 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  38.15 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1383  flagellar basal body rod protein FlgG  38.27 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  40.3 
 
 
262 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  39.56 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.55 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  38.38 
 
 
260 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  38.38 
 
 
260 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.97 
 
 
260 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0154  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.34 
 
 
263 aa  171  9e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.469359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  40.07 
 
 
262 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  37.63 
 
 
260 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  40.6 
 
 
262 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.5 
 
 
261 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  40.98 
 
 
262 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4197  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.71 
 
 
263 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  39.34 
 
 
262 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  38.89 
 
 
260 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.14 
 
 
261 aa  169  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  38.89 
 
 
260 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  40.66 
 
 
261 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.97 
 
 
261 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  40 
 
 
260 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  38.52 
 
 
260 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  39.71 
 
 
262 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2960  flagellar basal body rod protein FlgG  40.59 
 
 
261 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  0.156049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>