More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2960 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2960  flagellar basal body rod protein FlgG  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3252  flagellar basal body rod protein FlgG  74.71 
 
 		 261 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2605  flagellar basal body rod protein FlgG  69.35 
 
 		 261 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.772523  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  68.97 
 
 		 261 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2987  flagellar basal body rod protein FlgG  68.97 
 
 		 261 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2115  flagellar basal body rod protein FlgG  65.52 
 
 		 261 aa  362  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4193  flagellar basal body rod protein FlgG  65.9 
 
 		 261 aa  359  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  52.87 
 
 		 262 aa  272  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0823  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.31 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214606  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  50.57 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  51.35 
 
 		 262 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  50.96 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  52.12 
 
 		 262 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  52.12 
 
 		 262 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  53.64 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  52.96 
 
 		 262 aa  265  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.38 
 
 		 263 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1097  flagellar basal body rod protein FlgG  51.35 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4197  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.62 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  50.2 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  50.2 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3271  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.23 
 
 		 263 aa  252  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3047  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.23 
 
 		 263 aa  252  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.517234  normal  0.668581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  50.2 
 
 		 262 aa  251  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3245  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.85 
 
 		 263 aa  251  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  48.85 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.46 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  51.38 
 
 		 262 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.69 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1431  flagellar basal body rod protein FlgG  51.72 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.69 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.96 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.26 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  49.03 
 
 		 262 aa  248  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.96 
 
 		 261 aa  248  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0740  flagellar basal-body rod protein  50.39 
 
 		 263 aa  248  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  48.65 
 
 		 262 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.92 
 
 		 260 aa  248  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.92 
 
 		 260 aa  248  9e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.92 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1689  flagellar basal body rod protein FlgG  50.59 
 
 		 262 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.9 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  47.88 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  47.31 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  47.31 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  47.31 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  46.12 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  44.44 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  46.92 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  46.92 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  46.54 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  45.98 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  47.31 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1683  flagellar basal body rod protein FlgG  47.31 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.082538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4423  flagellar basal body rod protein FlgG  46.92 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.88 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  46.92 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  47.88 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  46.15 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.92 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  46.54 
 
 		 262 aa  241  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  45.77 
 
 		 262 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  46.54 
 
 		 262 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  50.76 
 
 		 264 aa  241  9e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  46.54 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  45.95 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  45.95 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  46.15 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  45.95 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  45.95 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  45.95 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  45.95 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.83 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  45.95 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  46.15 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  45.95 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  44.62 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.13 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0027  flagellar basal body rod protein FlgG  47.88 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1383  flagellar basal body rod protein FlgG  46.12 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  45.95 
 
 		 262 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  46.54 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  45.77 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.77 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  45.38 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  47.67 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  45 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.83 
 
 		 263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1121  flagellar basal body rod protein FlgG  46.09 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  48.03 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  42.91 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  47.51 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  47.43 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2965  flagellar basal body rod protein FlgG  45.74 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.21 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.68 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  46.15 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  44.83 
 
 		 262 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1602  flagellar basal body rod protein FlgG  48.45 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>