More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4712 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  100 
 
 		 261 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  85.38 
 
 		 260 aa  461  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  84.23 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  84.23 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  67.31 
 
 		 261 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  68.08 
 
 		 260 aa  374  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  67.69 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  68.85 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  66.92 
 
 		 261 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1959  flagellar basal-body rod FlgG  66.67 
 
 		 261 aa  362  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  67.05 
 
 		 262 aa  362  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  66.67 
 
 		 262 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  66.67 
 
 		 262 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  66.15 
 
 		 260 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  66.67 
 
 		 262 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  66.15 
 
 		 260 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  64.62 
 
 		 260 aa  358  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  66.54 
 
 		 262 aa  358  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 		 262 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  65 
 
 		 260 aa  357  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  66.67 
 
 		 262 aa  357  9e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 		 262 aa  357  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  65.77 
 
 		 260 aa  357  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 		 262 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 		 262 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  65 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  65.38 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2965  flagellar basal body rod protein FlgG  66.15 
 
 		 260 aa  356  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  65.77 
 
 		 260 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  65.77 
 
 		 260 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  65.77 
 
 		 260 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  65.77 
 
 		 260 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  65.9 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 		 262 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  65.38 
 
 		 260 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  65.38 
 
 		 260 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  65.38 
 
 		 260 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  65.38 
 
 		 260 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  65.38 
 
 		 260 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  65.38 
 
 		 260 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  65 
 
 		 260 aa  353  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  65 
 
 		 260 aa  353  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  65.77 
 
 		 260 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  63.46 
 
 		 260 aa  351  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  63.46 
 
 		 260 aa  348  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  64.23 
 
 		 260 aa  345  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  62.31 
 
 		 260 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  63.08 
 
 		 260 aa  342  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  62.31 
 
 		 260 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  59.62 
 
 		 260 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  59.46 
 
 		 261 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  58.46 
 
 		 260 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  59.62 
 
 		 260 aa  316  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  57.31 
 
 		 260 aa  315  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  57.31 
 
 		 260 aa  315  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  57.53 
 
 		 262 aa  313  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2003  flagellar basal-body rod protein FlgG  64.66 
 
 		 232 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  56.15 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  56.11 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.86 
 
 		 262 aa  308  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.64 
 
 		 263 aa  308  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  58.27 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  58.27 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.92 
 
 		 261 aa  301  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  53.64 
 
 		 262 aa  299  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  52.9 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  52.9 
 
 		 261 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  52.9 
 
 		 261 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  52.9 
 
 		 261 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  52.9 
 
 		 261 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  56.69 
 
 		 261 aa  294  8e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  53.85 
 
 		 262 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.85 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  52.51 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  53.67 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  52.87 
 
 		 262 aa  292  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  52.12 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  56.3 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  52.49 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  52.9 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  52.87 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0515  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.03 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308837  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  52.12 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  52.12 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0154  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.31 
 
 		 263 aa  278  6e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.469359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1482  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 		 262 aa  278  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.655215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.19 
 
 		 262 aa  278  8e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01292  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 		 262 aa  278  9e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02923  flagellar basal body rod protein FlgG  49.62 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  52.87 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004168  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.62 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1345  flagellar basal body rod protein FlgG  50.38 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1421  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2942  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>