More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1097 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1097  flagellar basal body rod protein FlgG  100 
 
 
262 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  71.37 
 
 
262 aa  384  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  71.37 
 
 
262 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  71.37 
 
 
262 aa  384  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  71.37 
 
 
262 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  70.61 
 
 
262 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  70.99 
 
 
262 aa  381  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  70.23 
 
 
262 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  68.7 
 
 
262 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1689  flagellar basal body rod protein FlgG  68.7 
 
 
262 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  66.03 
 
 
262 aa  367  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0027  flagellar basal body rod protein FlgG  66.67 
 
 
262 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  68.2 
 
 
262 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  66.41 
 
 
262 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  66.79 
 
 
262 aa  349  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  61.45 
 
 
264 aa  324  1e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0740  flagellar basal-body rod protein  58.17 
 
 
263 aa  305  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  52.57 
 
 
261 aa  275  7e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  51.16 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  54.44 
 
 
261 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1431  flagellar basal body rod protein FlgG  52.33 
 
 
262 aa  268  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3252  flagellar basal body rod protein FlgG  51.74 
 
 
261 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.47 
 
 
263 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0823  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.09 
 
 
263 aa  258  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214606  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2605  flagellar basal body rod protein FlgG  50.59 
 
 
261 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.772523  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2960  flagellar basal body rod protein FlgG  51.35 
 
 
261 aa  257  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4197  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.85 
 
 
263 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.62 
 
 
263 aa  254  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  48.65 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4193  flagellar basal body rod protein FlgG  51.38 
 
 
261 aa  252  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3271  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.71 
 
 
263 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3047  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.71 
 
 
263 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.517234  normal  0.668581 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2987  flagellar basal body rod protein FlgG  48.65 
 
 
261 aa  251  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3245  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.09 
 
 
263 aa  252  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.61 
 
 
262 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2115  flagellar basal body rod protein FlgG  50.59 
 
 
261 aa  249  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  49.61 
 
 
262 aa  248  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  48.45 
 
 
262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.72 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  48.06 
 
 
262 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  48.06 
 
 
262 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.95 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  48.46 
 
 
261 aa  242  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  45 
 
 
262 aa  241  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.18 
 
 
263 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  48.44 
 
 
262 aa  240  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  46.09 
 
 
262 aa  239  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  45.98 
 
 
261 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  45.98 
 
 
261 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.86 
 
 
262 aa  240  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  44.4 
 
 
260 aa  238  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.95 
 
 
262 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  44.4 
 
 
260 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  46.95 
 
 
262 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.77 
 
 
262 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  45.98 
 
 
261 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  45.98 
 
 
261 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  45.98 
 
 
261 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  45.17 
 
 
260 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  46.9 
 
 
262 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  45.17 
 
 
260 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  45.59 
 
 
261 aa  234  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  44.31 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  44.4 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  44.4 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  44.4 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.17 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.04 
 
 
262 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  45.98 
 
 
261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  44.02 
 
 
260 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.02 
 
 
260 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  44.02 
 
 
260 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  44.02 
 
 
260 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1383  flagellar basal body rod protein FlgG  46.95 
 
 
262 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  44.02 
 
 
260 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  44.02 
 
 
260 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  46.33 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  44.02 
 
 
260 aa  231  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.91 
 
 
260 aa  231  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.17 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.17 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  44.02 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  44.02 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  44.02 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  44.02 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  45.95 
 
 
260 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>