More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0258 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  100 
 
 
262 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  73.66 
 
 
262 aa  407  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  73.28 
 
 
262 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  73.28 
 
 
262 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  71.37 
 
 
262 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  72.14 
 
 
262 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  70.61 
 
 
262 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  69.35 
 
 
262 aa  377  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1097  flagellar basal body rod protein FlgG  66.03 
 
 
262 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  64.5 
 
 
262 aa  360  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0027  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 
262 aa  360  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  64.5 
 
 
262 aa  360  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  64.12 
 
 
262 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  61.83 
 
 
262 aa  346  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1689  flagellar basal body rod protein FlgG  61.83 
 
 
262 aa  343  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0740  flagellar basal-body rod protein  61.22 
 
 
263 aa  332  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  60.69 
 
 
264 aa  331  7.000000000000001e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  53.82 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  53.44 
 
 
261 aa  285  7e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1431  flagellar basal body rod protein FlgG  53.44 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3245  flagellar basal-body rod protein FlgG  50 
 
 
263 aa  265  8e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3047  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.24 
 
 
263 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.517234  normal  0.668581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0823  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.85 
 
 
263 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214606  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3271  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.24 
 
 
263 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.62 
 
 
263 aa  262  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4197  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.62 
 
 
263 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  52.12 
 
 
261 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  50.76 
 
 
262 aa  254  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.95 
 
 
263 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2960  flagellar basal body rod protein FlgG  49.03 
 
 
261 aa  248  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2605  flagellar basal body rod protein FlgG  46.72 
 
 
261 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.772523  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.46 
 
 
262 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2115  flagellar basal body rod protein FlgG  47.27 
 
 
261 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.33 
 
 
261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.33 
 
 
261 aa  245  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3252  flagellar basal body rod protein FlgG  46.33 
 
 
261 aa  245  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  47.67 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  46.72 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  46.9 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  49.22 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  46.9 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  242  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.22 
 
 
260 aa  241  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  46.72 
 
 
262 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.72 
 
 
262 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2987  flagellar basal body rod protein FlgG  46.72 
 
 
261 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.49 
 
 
260 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4423  flagellar basal body rod protein FlgG  48.47 
 
 
262 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.49 
 
 
260 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  48.06 
 
 
262 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.33 
 
 
262 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  47.31 
 
 
261 aa  236  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.95 
 
 
262 aa  237  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4193  flagellar basal body rod protein FlgG  46.33 
 
 
261 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.95 
 
 
264 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  46.95 
 
 
262 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  46.64 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.35 
 
 
261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  44.79 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  46.25 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  44.79 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.22 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.33 
 
 
261 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1683  flagellar basal body rod protein FlgG  46.18 
 
 
262 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.082538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  44.27 
 
 
262 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  46.25 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  46.56 
 
 
262 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2592  flagellar basal body rod protein FlgG  46.15 
 
 
262 aa  232  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.29 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1334  flagellar basal body rod protein FlgG  45.77 
 
 
262 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.77 
 
 
263 aa  230  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3244  flagellar basal body rod protein FlgG  46.15 
 
 
262 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  47.04 
 
 
260 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.33 
 
 
260 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1264  flagellar basal body rod protein FlgG  45.77 
 
 
262 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  45.77 
 
 
262 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.898516  normal  0.0829972 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.33 
 
 
260 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.95 
 
 
260 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  46.9 
 
 
262 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.72 
 
 
260 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1350  flagellar basal body rod protein FlgG  45.38 
 
 
262 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  44.66 
 
 
262 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.51 
 
 
262 aa  229  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  47.83 
 
 
260 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1602  flagellar basal body rod protein FlgG  45 
 
 
262 aa  228  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1383  flagellar basal body rod protein FlgG  46.18 
 
 
262 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.56 
 
 
260 aa  228  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.51 
 
 
262 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  44.66 
 
 
262 aa  228  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>