More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0740 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0740  flagellar basal-body rod protein  100 
 
 		 263 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  70.34 
 
 		 262 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  69.2 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  63.12 
 
 		 262 aa  333  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  63.12 
 
 		 262 aa  333  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  62.36 
 
 		 262 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  61.22 
 
 		 262 aa  332  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  60.08 
 
 		 262 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  58.02 
 
 		 262 aa  314  8e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  58.94 
 
 		 262 aa  308  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1097  flagellar basal body rod protein FlgG  58.17 
 
 		 262 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  58.17 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  58.17 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  57.79 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1689  flagellar basal body rod protein FlgG  55.89 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0027  flagellar basal body rod protein FlgG  54.58 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  53.61 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  53.61 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  52.47 
 
 		 261 aa  268  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.05 
 
 		 262 aa  265  8e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  53.46 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  51.56 
 
 		 262 aa  260  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  48.83 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3252  flagellar basal body rod protein FlgG  50.79 
 
 		 261 aa  258  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  50.19 
 
 		 262 aa  257  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1431  flagellar basal body rod protein FlgG  53.99 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  49.05 
 
 		 262 aa  255  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.34 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  51.35 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.95 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  51.74 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  51.35 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  51.35 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  49.22 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  50.95 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.82 
 
 		 263 aa  252  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  51.74 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  51.74 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  51.74 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  51.74 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  47.53 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  51.74 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  51.74 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  51.74 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  51.35 
 
 		 262 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2605  flagellar basal body rod protein FlgG  50.39 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.772523  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.04 
 
 		 260 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  51.17 
 
 		 262 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  51.17 
 
 		 262 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  48.29 
 
 		 262 aa  250  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  48.82 
 
 		 260 aa  249  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  47.15 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2987  flagellar basal body rod protein FlgG  50 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0797  flagellar basal body rod protein FlgG  48.66 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0866947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0721  flagellar basal body rod protein FlgG  48.66 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000178578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  50.97 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.81 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2960  flagellar basal body rod protein FlgG  50.39 
 
 		 261 aa  248  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  50.58 
 
 		 262 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4193  flagellar basal body rod protein FlgG  51.97 
 
 		 261 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 		 263 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000584839  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  49.81 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0823  flagellar basal-body rod protein FlgG  50 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214606  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  47.33 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  50.19 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  50.19 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.59 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.57 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3047  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.53 
 
 		 263 aa  245  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.517234  normal  0.668581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  49.43 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3271  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.53 
 
 		 263 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  48.66 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.81 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4197  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.05 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  47.69 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.45 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  49.81 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  48.66 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3245  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.53 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  47.33 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  47.71 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.31 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  47.33 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.22 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.03 
 
 		 262 aa  241  6e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  47.31 
 
 		 261 aa  241  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  48.66 
 
 		 261 aa  241  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.04 
 
 		 262 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  49.24 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  50 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.46 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  50 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.46 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  46.92 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.54 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4423  flagellar basal body rod protein FlgG  48.48 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>