More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3100 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 
270 aa  551  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  63.33 
 
 
266 aa  345  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.93 
 
 
267 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  54.44 
 
 
266 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  47.62 
 
 
265 aa  234  2.0000000000000002e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  43.59 
 
 
271 aa  221  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.2 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  43.32 
 
 
262 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.93 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.93 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  43.12 
 
 
262 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.27 
 
 
262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.59 
 
 
263 aa  211  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  46.32 
 
 
261 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.59 
 
 
264 aa  208  8e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.64 
 
 
261 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  45.22 
 
 
260 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  40.94 
 
 
262 aa  205  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  40.58 
 
 
262 aa  204  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.07 
 
 
266 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.07 
 
 
266 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.46 
 
 
262 aa  202  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  42.7 
 
 
266 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  44.2 
 
 
260 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  40.81 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.3 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.02 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.6 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.94 
 
 
260 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.94 
 
 
260 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1007  flagellar basal body rod protein FlgG  42.86 
 
 
264 aa  198  7e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  43.53 
 
 
264 aa  198  7e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.12 
 
 
261 aa  198  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  44.85 
 
 
261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  40.07 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.81 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  43.27 
 
 
260 aa  195  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  39.86 
 
 
262 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1156  flagellar basal body rod protein FlgG  42.44 
 
 
261 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1308  flagellar basal body rod protein FlgG  42.4 
 
 
263 aa  193  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000584839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.01 
 
 
261 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0797  flagellar basal body rod protein FlgG  42.4 
 
 
263 aa  192  5e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0866947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0721  flagellar basal body rod protein FlgG  42.4 
 
 
263 aa  192  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000178578  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.66 
 
 
260 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  41.48 
 
 
260 aa  191  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  40.58 
 
 
262 aa  191  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.91 
 
 
260 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  41.54 
 
 
262 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.74 
 
 
260 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  40.58 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.93 
 
 
266 aa  188  7e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.05 
 
 
260 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.76 
 
 
263 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.13 
 
 
260 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  41.3 
 
 
262 aa  185  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.94 
 
 
262 aa  185  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.62 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1383  flagellar basal body rod protein FlgG  41.01 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3068  flagellar basal body and hook protein  41.33 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.548928  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  39.25 
 
 
260 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  41.91 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  38.63 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  40.75 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  41.88 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  39.39 
 
 
260 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.35 
 
 
263 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.85 
 
 
260 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  40.75 
 
 
260 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  42.65 
 
 
264 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.48 
 
 
262 aa  180  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  41.95 
 
 
261 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  39.34 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  39.34 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  39.34 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4197  flagellar basal-body rod protein FlgG  38.63 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  39.34 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1683  flagellar basal body rod protein FlgG  39.35 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.082538 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  39.34 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  39.34 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  41.95 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  39.34 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.67 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  41.57 
 
 
261 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  40.3 
 
 
262 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  40.82 
 
 
261 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  39.93 
 
 
260 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  39.93 
 
 
260 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  39.18 
 
 
260 aa  178  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  39.25 
 
 
262 aa  178  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1121  flagellar basal body rod protein FlgG  40.29 
 
 
262 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0823  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.99 
 
 
263 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214606  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  41.16 
 
 
262 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1431  flagellar basal body rod protein FlgG  42.18 
 
 
262 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  38.97 
 
 
262 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  39.64 
 
 
261 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2965  flagellar basal body rod protein FlgG  39.25 
 
 
260 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22311  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  39.1 
 
 
261 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  38.75 
 
 
262 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  41.2 
 
 
261 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  39.13 
 
 
262 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>