More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3829 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3829  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  90.48 
 
 		 294 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0335903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4204  hypothetical protein  72.11 
 
 		 294 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3295  protein of unknown function DUF1078 domain protein  50 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3435  hypothetical protein  47.96 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  36.18 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  35.84 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.99 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  52.6 
 
 		 419 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  57.89 
 
 		 419 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  35.12 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  32.23 
 
 		 264 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  31.76 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.11 
 
 		 276 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  32.13 
 
 		 271 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  48.51 
 
 		 545 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0414  hypothetical protein  30.34 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  47.76 
 
 		 564 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.79 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  46.32 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.59 
 
 		 562 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  30.64 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  31.92 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.98 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2386  hypothetical protein  30.41 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.02 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4123  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.67 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  32.47 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  32.47 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  32.47 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  32.47 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  32.47 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  32.47 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  32.47 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  31.95 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0050  fagellar hook-basal body protein  31.23 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  42.94 
 
 		 433 aa  113  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  32.14 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  31.79 
 
 		 262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.54 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  31.54 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  29.1 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  30.79 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  31.37 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  31.46 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  31.13 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  31.37 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.58 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.58 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2910  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.79 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  29.87 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.83 
 
 		 808 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  28.85 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.92 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  32 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  30.49 
 
 		 262 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.29 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.47 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  30.85 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  30.85 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  31.99 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2406  flagellar basal body rod protein FlgG  31.7 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3020  flagellar basal body rod protein FlgG  31.7 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0744424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3039  flagellar basal body rod protein FlgG  31.7 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  30.26 
 
 		 260 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  30.2 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  29.8 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  28.52 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  30.03 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.87 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.41 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  31.6 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  48.25 
 
 		 527 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  30.41 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.9 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  28.2 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  29.97 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  30.98 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  31.35 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.57 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  31.08 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  30.69 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  30.72 
 
 		 262 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  31.53 
 
 		 261 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.95 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  30.72 
 
 		 262 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  40.41 
 
 		 856 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.44 
 
 		 262 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0740  flagellar basal-body rod protein  31.6 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.56 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.66 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.7 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.72 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  30.3 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  30.3 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  29.93 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  39.01 
 
 		 428 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  31.02 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  31.02 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.72 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>