More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2400 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  100 
 
 		 856 aa  1713    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  49.43 
 
 		 266 aa  164  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  51.88 
 
 		 463 aa  160  8e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  53.55 
 
 		 398 aa  157  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  55.24 
 
 		 442 aa  156  1e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  55.07 
 
 		 508 aa  150  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  46.81 
 
 		 265 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  55.47 
 
 		 275 aa  146  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  57.46 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  51.57 
 
 		 263 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  56.25 
 
 		 519 aa  143  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  49.13 
 
 		 394 aa  142  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  43.24 
 
 		 475 aa  142  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  49.68 
 
 		 408 aa  141  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  46.52 
 
 		 264 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  50.94 
 
 		 390 aa  141  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  52.21 
 
 		 441 aa  140  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  49.32 
 
 		 417 aa  138  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  51.8 
 
 		 310 aa  138  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.65 
 
 		 462 aa  137  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  51.47 
 
 		 623 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  51.47 
 
 		 750 aa  135  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  52.55 
 
 		 702 aa  135  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.9 
 
 		 276 aa  134  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  52.55 
 
 		 819 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  48.55 
 
 		 440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.53 
 
 		 636 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.4 
 
 		 415 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  51.82 
 
 		 814 aa  129  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.83 
 
 		 454 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  50.36 
 
 		 488 aa  126  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  53.17 
 
 		 426 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  46.06 
 
 		 718 aa  124  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  41.04 
 
 		 770 aa  120  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  53.33 
 
 		 282 aa  120  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  47.45 
 
 		 845 aa  119  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0414  hypothetical protein  45.32 
 
 		 312 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  43.71 
 
 		 911 aa  119  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  47.45 
 
 		 838 aa  118  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  49.22 
 
 		 562 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  47.1 
 
 		 479 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  48.18 
 
 		 814 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  49.6 
 
 		 451 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  43.48 
 
 		 851 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  47.45 
 
 		 875 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  38.51 
 
 		 705 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  47.97 
 
 		 441 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1399  fagellar hook-basal body protein  48.2 
 
 		 335 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  40.85 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  46.4 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  44.31 
 
 		 428 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  49.22 
 
 		 413 aa  112  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  47.01 
 
 		 266 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.95 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.32 
 
 		 265 aa  111  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  45.8 
 
 		 564 aa  111  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.71 
 
 		 428 aa  111  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.71 
 
 		 428 aa  111  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  48.36 
 
 		 584 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  40.85 
 
 		 260 aa  108  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0050  fagellar hook-basal body protein  46.43 
 
 		 293 aa  107  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.24 
 
 		 260 aa  107  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  44.35 
 
 		 442 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  45.24 
 
 		 419 aa  107  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  41.81 
 
 		 280 aa  107  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.39 
 
 		 263 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  39.52 
 
 		 260 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.53 
 
 		 545 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  39.77 
 
 		 261 aa  105  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  39.29 
 
 		 260 aa  105  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  43.38 
 
 		 260 aa  105  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  44.8 
 
 		 419 aa  104  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  40.68 
 
 		 262 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  40.68 
 
 		 262 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3477  flagellar basal body rod protein:protein of unknown function DUF1078:flagellar basal body FlaE  33.71 
 
 		 582 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  40.68 
 
 		 262 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  40.68 
 
 		 262 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  40.68 
 
 		 262 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  40.68 
 
 		 262 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  40.13 
 
 		 637 aa  103  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  40.68 
 
 		 262 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  40.35 
 
 		 262 aa  103  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  35.85 
 
 		 260 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.97 
 
 		 261 aa  103  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1544  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.8 
 
 		 262 aa  102  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.349989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  37.5 
 
 		 255 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.97 
 
 		 261 aa  102  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  46.04 
 
 		 264 aa  102  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3829  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.41 
 
 		 294 aa  102  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  54.44 
 
 		 496 aa  102  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  39.41 
 
 		 262 aa  102  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.47 
 
 		 267 aa  101  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  46.72 
 
 		 438 aa  101  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.19 
 
 		 808 aa  101  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3580  hypothetical protein  41.38 
 
 		 565 aa  101  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.304343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  40.11 
 
 		 262 aa  101  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.76 
 
 		 266 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.76 
 
 		 266 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  43.66 
 
 		 462 aa  101  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  54.44 
 
 		 527 aa  101  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>