More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3435 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3435  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  512  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3829  protein of unknown function DUF1078 domain protein  48.3 
 
 
294 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4204  hypothetical protein  49.66 
 
 
294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  48.3 
 
 
294 aa  242  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0335903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3295  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.28 
 
 
296 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  60.32 
 
 
419 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  37.04 
 
 
266 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  35.56 
 
 
265 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  58.4 
 
 
419 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  34.81 
 
 
264 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.06 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  35.84 
 
 
275 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  34.07 
 
 
262 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.19 
 
 
263 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2621  protein of unknown function DUF1078-like protein  34.32 
 
 
266 aa  135  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.45 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.97 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.7 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  34.44 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  32.96 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0050  fagellar hook-basal body protein  32.21 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  50.74 
 
 
564 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.1 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  49.61 
 
 
413 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  33.33 
 
 
260 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0244  hypothetical protein  33.09 
 
 
271 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.450187  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  34.44 
 
 
260 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  34.07 
 
 
260 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.84 
 
 
265 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.95 
 
 
263 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  34.1 
 
 
261 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  50.39 
 
 
545 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  34.44 
 
 
261 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  35.74 
 
 
262 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  31.48 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  35.16 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  32.1 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  33.95 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.43 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  34.98 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  31.75 
 
 
310 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  32.25 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0104  flagellar basal body rod protein FlgG  30.74 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000105061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  34.7 
 
 
260 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1714  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.7 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0078  flagellar distal rod protein  33.7 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36216  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.18 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  50.39 
 
 
433 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  34.2 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1345  flagellar basal body rod protein FlgG  32.08 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  32.72 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  34.22 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.8 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.7 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  34.22 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.82 
 
 
260 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2386  hypothetical protein  33.08 
 
 
266 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.82 
 
 
260 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  35.07 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  34.25 
 
 
260 aa  115  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  32.72 
 
 
262 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  34.34 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  30.74 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  33.09 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  33.09 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  32.57 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  32.57 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  33.2 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  34.21 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  31.99 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  31.99 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  31.99 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  31.99 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.73 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  33.09 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  31.99 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  31.99 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  31.99 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  32.71 
 
 
262 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  32.71 
 
 
262 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.66 
 
 
562 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.85 
 
 
260 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.1 
 
 
266 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.1 
 
 
266 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.46 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  30 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  32.7 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1350  flagellar basal body rod protein FlgG  31.7 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  32.71 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.75 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1264  flagellar basal body rod protein FlgG  31.8 
 
 
262 aa  111  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.81 
 
 
261 aa  111  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  32.47 
 
 
262 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  32.22 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  31.95 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3082  flagellar basal body rod protein FlgG  30.19 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  32.31 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  32.31 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>