More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1471 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1471  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1088    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  31.53 
 
 		 440 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  30.6 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1480  flagellar hook protein FlgE  29.44 
 
 		 554 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  27.93 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  29.85 
 
 		 450 aa  192  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  28.31 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  29.13 
 
 		 442 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  29.07 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  30 
 
 		 451 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  28.49 
 
 		 462 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  27.92 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  31.03 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.77 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  27.91 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.2 
 
 		 525 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  27.76 
 
 		 462 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  29.68 
 
 		 441 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  29.42 
 
 		 443 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.36 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  26.49 
 
 		 461 aa  166  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  28.46 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  30 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  26.77 
 
 		 564 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  27.54 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  27.79 
 
 		 475 aa  161  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.81 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  26.53 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  28.87 
 
 		 527 aa  154  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  26.52 
 
 		 437 aa  150  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.87 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  27.8 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  28.49 
 
 		 417 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  28.75 
 
 		 519 aa  140  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.27 
 
 		 488 aa  140  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.54 
 
 		 513 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1010  hypothetical protein  27.35 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819939  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  39.89 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  26.57 
 
 		 498 aa  128  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  41.05 
 
 		 402 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  41.05 
 
 		 402 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2731  hypothetical protein  40.7 
 
 		 501 aa  126  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000961084 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  27 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  40.11 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  42.66 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  41.56 
 
 		 408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  39.74 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  35.11 
 
 		 401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  42.57 
 
 		 408 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  43.36 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  28.62 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  37.43 
 
 		 637 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  42.66 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  42.66 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  42.66 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  43.75 
 
 		 413 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  36.31 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  43.06 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  38.19 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  40.48 
 
 		 407 aa  115  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  41.07 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  40.48 
 
 		 407 aa  115  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  35.83 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  41.96 
 
 		 414 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  39.77 
 
 		 398 aa  114  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  53.39 
 
 		 403 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  53.39 
 
 		 403 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  53.39 
 
 		 403 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  53.39 
 
 		 403 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  53.39 
 
 		 403 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  38.19 
 
 		 453 aa  113  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  53.39 
 
 		 401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  53.39 
 
 		 402 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  53.39 
 
 		 402 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  25.56 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  35.91 
 
 		 804 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  43.29 
 
 		 404 aa  113  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  53.39 
 
 		 402 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  53.39 
 
 		 401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  53.39 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  53.39 
 
 		 401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01080  hypothetical protein  52.54 
 
 		 219 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  52.54 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  37.5 
 
 		 455 aa  110  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  40.74 
 
 		 399 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  36.71 
 
 		 425 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  38.19 
 
 		 453 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  40.74 
 
 		 418 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  31.82 
 
 		 407 aa  110  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  27.59 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  39.58 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3103  flagellar basal body FlaE domain protein  36.77 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  37.5 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>