More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2532 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 460 aa  907    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  39.74 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  36.09 
 
 		 421 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  37.83 
 
 		 412 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  36.46 
 
 		 419 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  32.7 
 
 		 461 aa  192  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  31.91 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  32.1 
 
 		 419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  32.4 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  31.91 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  31.39 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.4 
 
 		 400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  31.46 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  31.3 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  32.03 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  31.42 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  29.68 
 
 		 452 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  31.77 
 
 		 438 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  30.23 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  30.19 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  29.7 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  29.05 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  30.6 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  31.61 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  30.54 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.6 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  28.71 
 
 		 496 aa  153  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  30.33 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  31.47 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  29.93 
 
 		 420 aa  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  29.61 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  29.83 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  30.74 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  28.98 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  28.98 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  30.24 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  28.03 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  29.47 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  32.37 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  26.45 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  29.3 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  27.31 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  29.3 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.36 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  28.85 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  32.26 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  30.07 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  30.69 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  31.22 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  29.3 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  28.48 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  27.56 
 
 		 407 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  27.78 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  32.69 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  27.84 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  28.11 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  30.79 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  30.11 
 
 		 398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  26.81 
 
 		 564 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  30.34 
 
 		 442 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  27.96 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.39 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  30.21 
 
 		 430 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1471  hypothetical protein  28.62 
 
 		 538 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  30.69 
 
 		 430 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.54 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  27.89 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  26.91 
 
 		 453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  26.91 
 
 		 453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  26.91 
 
 		 453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  27.61 
 
 		 426 aa  136  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  27.64 
 
 		 454 aa  136  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  29.91 
 
 		 402 aa  136  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  29.89 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  29.02 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.15 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  27.43 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  27.72 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  25.05 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  29.48 
 
 		 401 aa  134  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  29.68 
 
 		 461 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  29.41 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  26.93 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.51 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  28.04 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.5 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  29.07 
 
 		 401 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  29.07 
 
 		 401 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  27.91 
 
 		 437 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  29.19 
 
 		 401 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  27.74 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  28.7 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  29.4 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  27.45 
 
 		 396 aa  130  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  28.21 
 
 		 437 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  27.78 
 
 		 453 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  28.51 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  28.51 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  28.51 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  28.6 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>