More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5531 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  96.51 
 
 
430 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
430 aa  831    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  74.31 
 
 
432 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  72.98 
 
 
433 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  49.77 
 
 
422 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  50.46 
 
 
402 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  48.96 
 
 
418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  49.07 
 
 
415 aa  343  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  46.76 
 
 
402 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  47.34 
 
 
411 aa  339  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  47.82 
 
 
426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  49.54 
 
 
414 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  47.82 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  45.27 
 
 
403 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  46.65 
 
 
396 aa  326  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  43.98 
 
 
403 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  43.35 
 
 
407 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  45.6 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  44.57 
 
 
377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  35.36 
 
 
404 aa  236  6e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
399 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  34.4 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.55 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.87 
 
 
413 aa  183  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.74 
 
 
423 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  30.96 
 
 
454 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  33.33 
 
 
440 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  33.61 
 
 
461 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  33.94 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  33.72 
 
 
413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  34.15 
 
 
421 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  33.87 
 
 
402 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  31.61 
 
 
425 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  33.63 
 
 
413 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  34.74 
 
 
419 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.57 
 
 
395 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  34.63 
 
 
413 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  33.64 
 
 
404 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.99 
 
 
426 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  28.95 
 
 
450 aa  169  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  33.11 
 
 
414 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  34.49 
 
 
413 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  32.43 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  33.18 
 
 
401 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  32.51 
 
 
413 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  32.29 
 
 
413 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  32.29 
 
 
413 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  32.44 
 
 
442 aa  166  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  30.24 
 
 
452 aa  166  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  32.05 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.16 
 
 
456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  34.26 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.37 
 
 
435 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  33.11 
 
 
412 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 
421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  30.17 
 
 
446 aa  162  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  31.2 
 
 
425 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  32.95 
 
 
398 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  31.57 
 
 
410 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.57 
 
 
428 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  32.87 
 
 
402 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.06 
 
 
454 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  32.87 
 
 
402 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  31.47 
 
 
413 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.57 
 
 
428 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  31.13 
 
 
417 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  32.2 
 
 
404 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  31.53 
 
 
420 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  32.81 
 
 
419 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  32.8 
 
 
417 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  31.66 
 
 
407 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  31.98 
 
 
414 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
415 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  29.07 
 
 
475 aa  159  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  32.04 
 
 
405 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  33.56 
 
 
419 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 
394 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  32.48 
 
 
395 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  28.67 
 
 
422 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  30.66 
 
 
428 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  31.39 
 
 
434 aa  156  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  30.66 
 
 
428 aa  156  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  30.66 
 
 
428 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  31.97 
 
 
410 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  32.79 
 
 
395 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.9 
 
 
397 aa  156  8e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  32.65 
 
 
407 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  31.87 
 
 
398 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  31.1 
 
 
414 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  32.65 
 
 
407 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  32.34 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  31.59 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  30.87 
 
 
414 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  30.87 
 
 
414 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.25 
 
 
418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  31.63 
 
 
401 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  31.12 
 
 
403 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  31.12 
 
 
403 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  31.48 
 
 
413 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>