More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0470 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 411 aa  788    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  58.43 
 
 		 418 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  47.34 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  47.11 
 
 		 430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  45.06 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  46 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  45.52 
 
 		 415 aa  322  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  42.49 
 
 		 422 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  42.89 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  41.04 
 
 		 411 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  38.39 
 
 		 403 aa  276  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  40.43 
 
 		 407 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  37.5 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  38.86 
 
 		 403 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  38.32 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  38.86 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  39.86 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  39.07 
 
 		 402 aa  259  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  39.76 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.95 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.95 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  35.9 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  32.93 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  33.58 
 
 		 400 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  32.45 
 
 		 405 aa  186  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.33 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  31.54 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  33.26 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  32.13 
 
 		 417 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  32.17 
 
 		 413 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  35.35 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  33.8 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.14 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.08 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  31.73 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  31.49 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  31.73 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  31.73 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  31.49 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  32.69 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  32.08 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  30.86 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  30.86 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  32.79 
 
 		 419 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  34.29 
 
 		 401 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  30.92 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  30.92 
 
 		 402 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.34 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  30.86 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.03 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  31.25 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  31.16 
 
 		 401 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  31.16 
 
 		 401 aa  169  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  31.84 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  32.1 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  30.73 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  31.54 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  34.32 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  32.32 
 
 		 413 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  30.17 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  31.19 
 
 		 398 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  29.11 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  32.62 
 
 		 401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  31.86 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  33.03 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  29.11 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  31.86 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  29.11 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  31.86 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  30.43 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.37 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  31.29 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  31.71 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  32.48 
 
 		 414 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.22 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  30.87 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.67 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  30.62 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  30.94 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  32.33 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  30.14 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  34.46 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  33.94 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  31.93 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  32.15 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  31.58 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  32.15 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  30.29 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  29.69 
 
 		 433 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  31.08 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  29.74 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  30.42 
 
 		 404 aa  156  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  29.33 
 
 		 410 aa  156  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  29.47 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  29.93 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  29.96 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  29.86 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  30.2 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>