More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4184 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  100 
 
 		 456 aa  886    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  78.95 
 
 		 456 aa  694    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  60.3 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  59.65 
 
 		 460 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  59.44 
 
 		 460 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  53.86 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  47.91 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  50.11 
 
 		 466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  43.87 
 
 		 454 aa  359  7e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  52.59 
 
 		 613 aa  242  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  51.79 
 
 		 615 aa  240  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  49.03 
 
 		 601 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  48.21 
 
 		 598 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  44.25 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  44.25 
 
 		 610 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.64 
 
 		 598 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  32.35 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  31.17 
 
 		 426 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  31.16 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  31.59 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.05 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.91 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  30.89 
 
 		 396 aa  156  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  32.15 
 
 		 421 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  30.02 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  32.14 
 
 		 421 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  31.09 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  29.41 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  30.42 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.98 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  29.36 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  28.78 
 
 		 425 aa  143  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  29.83 
 
 		 402 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  29.81 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  30.31 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  30.42 
 
 		 401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  29.5 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  32.08 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  28.87 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  31.62 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  29.3 
 
 		 413 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  30.32 
 
 		 410 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  31.84 
 
 		 405 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  32.41 
 
 		 413 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  28.51 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  31.02 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  29.45 
 
 		 419 aa  134  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.08 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  29.11 
 
 		 415 aa  133  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.36 
 
 		 435 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  32.08 
 
 		 400 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  29.18 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  30.44 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  32.4 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.11 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  32.91 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  30.96 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  30.96 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  30.96 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  31.28 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  32.18 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  32.18 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  32.18 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  32.18 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  32.69 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  29.25 
 
 		 461 aa  130  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  32.18 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  32.69 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  32.18 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  29.61 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  31.77 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.55 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.96 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  29.32 
 
 		 402 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  29.32 
 
 		 402 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  28.12 
 
 		 417 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  30.51 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  27.94 
 
 		 496 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.51 
 
 		 397 aa  127  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  30.26 
 
 		 413 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  27.64 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1843  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.63 
 
 		 273 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3689  hypothetical protein  47.76 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  30.17 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  30.63 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  29.17 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.25 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  29.49 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  29.64 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  29.72 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  28.94 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  30.17 
 
 		 415 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  30.13 
 
 		 398 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.27 
 
 		 390 aa  123  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  30.85 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  26.53 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  30.7 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  28.57 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  25.05 
 
 		 404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>