More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5537 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  62.94 
 
 		 613 aa  716    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  62.9 
 
 		 615 aa  689    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  100 
 
 		 601 aa  1160    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  53.93 
 
 		 598 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  53.61 
 
 		 599 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  52.87 
 
 		 598 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  52.91 
 
 		 610 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  50.43 
 
 		 456 aa  231  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  49.03 
 
 		 456 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  46.28 
 
 		 454 aa  227  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.09 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  45.31 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.92 
 
 		 460 aa  209  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  47.97 
 
 		 461 aa  204  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  41.11 
 
 		 464 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  43.53 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3689  hypothetical protein  50.74 
 
 		 263 aa  125  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.87 
 
 		 636 aa  125  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.22 
 
 		 501 aa  124  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.431038 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3682  flagellar basal body FlaE domain protein  28.14 
 
 		 562 aa  117  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1843  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.4 
 
 		 273 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  45.77 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  45.07 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  44.97 
 
 		 425 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  38.25 
 
 		 419 aa  108  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  36.8 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  32.09 
 
 		 475 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  39.34 
 
 		 419 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2431  hypothetical protein  34.62 
 
 		 442 aa  105  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  33.61 
 
 		 421 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  32.11 
 
 		 442 aa  103  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.69 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3444  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.55 
 
 		 569 aa  102  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  54.55 
 
 		 623 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  36.23 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  36.28 
 
 		 705 aa  100  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  36.27 
 
 		 419 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.01 
 
 		 428 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.01 
 
 		 428 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  37.07 
 
 		 564 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  36.06 
 
 		 432 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  35.83 
 
 		 426 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  32.92 
 
 		 911 aa  97.4  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.92 
 
 		 413 aa  97.1  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  37.59 
 
 		 501 aa  97.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 814 aa  96.7  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  38.57 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  32.28 
 
 		 398 aa  96.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2731  hypothetical protein  29.02 
 
 		 501 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000961084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  29.75 
 
 		 404 aa  96.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  32.68 
 
 		 519 aa  95.9  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  43.07 
 
 		 415 aa  94.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.16 
 
 		 525 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  28.46 
 
 		 420 aa  94.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.06 
 
 		 808 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  32.2 
 
 		 402 aa  94  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  38.82 
 
 		 750 aa  94  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.47 
 
 		 562 aa  93.6  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  39.1 
 
 		 498 aa  94  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.42 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.69 
 
 		 390 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  34.64 
 
 		 394 aa  92.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  31.06 
 
 		 417 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  38.3 
 
 		 428 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.43 
 
 		 430 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  36.84 
 
 		 398 aa  92.8  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.06 
 
 		 435 aa  92  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  36.56 
 
 		 396 aa  92  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.11 
 
 		 545 aa  92  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  31.05 
 
 		 819 aa  92  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1471  hypothetical protein  35.81 
 
 		 538 aa  91.3  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  38.46 
 
 		 461 aa  91.3  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.45 
 
 		 415 aa  90.5  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  40.43 
 
 		 411 aa  90.5  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  36.51 
 
 		 409 aa  90.5  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.05 
 
 		 418 aa  90.9  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  30.61 
 
 		 440 aa  90.5  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  29.75 
 
 		 718 aa  89.7  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  32.8 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  36.87 
 
 		 851 aa  89.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  29.7 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0546  hypothetical protein  37.21 
 
 		 661 aa  89.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.3 
 
 		 488 aa  89.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  34.27 
 
 		 399 aa  89  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  31.32 
 
 		 404 aa  88.6  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  28.1 
 
 		 407 aa  88.2  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  29.83 
 
 		 408 aa  88.2  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  29.76 
 
 		 410 aa  88.2  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.33 
 
 		 454 aa  88.2  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  35.53 
 
 		 770 aa  88.2  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  35.51 
 
 		 637 aa  88.2  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  40.44 
 
 		 414 aa  87.8  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.34 
 
 		 423 aa  87.8  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  29.96 
 
 		 401 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  37.9 
 
 		 413 aa  87.4  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0143  putative flagellar hook protein FlgE  30.85 
 
 		 503 aa  87.4  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  87  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  34.44 
 
 		 398 aa  87  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.1 
 
 		 513 aa  87  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>