More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1843 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1843  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3689  hypothetical protein  39.11 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  57.24 
 
 		 610 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  53.8 
 
 		 598 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  55.92 
 
 		 598 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  54.11 
 
 		 599 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  47.85 
 
 		 461 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  46.63 
 
 		 456 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  53.06 
 
 		 615 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  45.51 
 
 		 456 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  51.7 
 
 		 613 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.51 
 
 		 460 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  45.4 
 
 		 601 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.2 
 
 		 460 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  38.2 
 
 		 460 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  44.52 
 
 		 466 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  47.37 
 
 		 454 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  43.04 
 
 		 464 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  30.21 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  40.72 
 
 		 425 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  30.17 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  28.18 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.39 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1959  flagellar basal-body rod FlgG  27.7 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.43 
 
 		 261 aa  92.4  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  30 
 
 		 261 aa  92  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  28.67 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3444  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40 
 
 		 569 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  28.08 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  26.94 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  28.96 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.77 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  27.74 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  26.69 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  30.54 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  26.19 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  28.67 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.62 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2923  flagellar basal-body rod FlgG  28.08 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  26.67 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  29.83 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  27.03 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  28.08 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  27.67 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  28.52 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  28.77 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  28.38 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1383  flagellar basal body rod protein FlgG  27.18 
 
 		 262 aa  85.9  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2337  flagellar basal-body rod protein FlgG  25.35 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  27.85 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4197  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.14 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.37 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  28.09 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  27.7 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  27.7 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2912  flagellar basal body rod protein FlgG  28.82 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  27.8 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0798  hypothetical protein  28.18 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0523636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.07 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  26.92 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.37 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3245  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.49 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  26.94 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  28.03 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  26.71 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  26.01 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  26.71 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  28.03 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  27.12 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  27.99 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  27 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  27.46 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.65 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0740  flagellar basal-body rod protein  28.14 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  27.46 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  37.93 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  27 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.856414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  28.47 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2930  flagellar basal body rod protein FlgG  27.09 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01292  flagellar basal body rod protein FlgG  26.92 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3065  flagellar basal body rod protein FlgG  27.09 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.798447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  28.47 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  28.09 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.81 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  25.25 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004168  flagellar basal-body rod protein FlgG  26.83 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  28.47 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.57 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  28.17 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>