More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3817 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  86.12 
 
 		 598 aa  1004    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  100 
 
 		 598 aa  1181    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  83.14 
 
 		 599 aa  973    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  83.28 
 
 		 610 aa  957    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  55.95 
 
 		 613 aa  623  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  54.26 
 
 		 601 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  54.63 
 
 		 615 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  53.11 
 
 		 454 aa  267  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  47.87 
 
 		 456 aa  231  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.9 
 
 		 460 aa  226  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  48.21 
 
 		 456 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  47.2 
 
 		 460 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.5 
 
 		 460 aa  210  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  46.72 
 
 		 461 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  42.11 
 
 		 464 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  43.35 
 
 		 466 aa  189  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1010  hypothetical protein  30.39 
 
 		 556 aa  163  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819939  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1843  protein of unknown function DUF1078 domain protein  55.92 
 
 		 273 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3689  hypothetical protein  50.75 
 
 		 263 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  46.62 
 
 		 425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0143  putative flagellar hook protein FlgE  27.14 
 
 		 503 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  32.92 
 
 		 433 aa  103  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  30.94 
 
 		 814 aa  103  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  29.75 
 
 		 819 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  32.37 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.74 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.74 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  39.33 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  44.35 
 
 		 419 aa  101  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  41.13 
 
 		 475 aa  101  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  32.79 
 
 		 421 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.83 
 
 		 488 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  40.8 
 
 		 564 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  33.17 
 
 		 417 aa  97.8  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  38.51 
 
 		 413 aa  97.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  40.32 
 
 		 501 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  33.06 
 
 		 851 aa  95.9  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.8 
 
 		 545 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  38.42 
 
 		 414 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  39.74 
 
 		 428 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  37.27 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  55.77 
 
 		 523 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.58 
 
 		 462 aa  94.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  40.48 
 
 		 498 aa  93.6  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.74 
 
 		 562 aa  92.8  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  46.26 
 
 		 623 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3444  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.7 
 
 		 569 aa  92.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  30.29 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  30.3 
 
 		 401 aa  91.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  29.8 
 
 		 450 aa  91.7  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  33.15 
 
 		 441 aa  90.9  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  26.44 
 
 		 623 aa  90.9  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.33 
 
 		 435 aa  90.9  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  36 
 
 		 414 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  36 
 
 		 414 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  36.51 
 
 		 440 aa  90.5  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  30.17 
 
 		 404 aa  90.5  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  34.87 
 
 		 705 aa  90.5  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  36 
 
 		 414 aa  90.9  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30 
 
 		 423 aa  90.5  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35 
 
 		 454 aa  90.5  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  26.44 
 
 		 750 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  29.37 
 
 		 401 aa  90.1  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.55 
 
 		 525 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.98 
 
 		 808 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  38.71 
 
 		 527 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  30.54 
 
 		 718 aa  89.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  38.57 
 
 		 413 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.58 
 
 		 636 aa  88.6  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  40.14 
 
 		 432 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  34.12 
 
 		 404 aa  88.2  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  38.81 
 
 		 396 aa  87.4  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  36.29 
 
 		 394 aa  87.8  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  32.34 
 
 		 417 aa  87.4  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  37.86 
 
 		 430 aa  87.4  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.74 
 
 		 513 aa  87.4  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  34.19 
 
 		 398 aa  87.4  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  36.18 
 
 		 911 aa  87.4  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  33.71 
 
 		 426 aa  87  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  37.86 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  25.55 
 
 		 584 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  37.86 
 
 		 413 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  33.67 
 
 		 410 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4674  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.25 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  30.88 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.8 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.68 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  36.22 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  37.8 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>