More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1331 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  62.9 
 
 		 601 aa  707    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  87.15 
 
 		 613 aa  1011    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  100 
 
 		 615 aa  1196    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  57.1 
 
 		 610 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  54.38 
 
 		 599 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  54.15 
 
 		 598 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  54.63 
 
 		 598 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  51.79 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  49.07 
 
 		 456 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  46.22 
 
 		 454 aa  226  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  47.33 
 
 		 461 aa  209  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.18 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.99 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  46.91 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  42.69 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  42.52 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.28 
 
 		 636 aa  140  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1843  protein of unknown function DUF1078 domain protein  53.06 
 
 		 273 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3689  hypothetical protein  48.92 
 
 		 263 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  34.54 
 
 		 814 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  38.15 
 
 		 421 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  35.95 
 
 		 421 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  34.02 
 
 		 440 aa  112  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  47.65 
 
 		 425 aa  110  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  31.73 
 
 		 819 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1010  hypothetical protein  43.51 
 
 		 556 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819939  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  31.92 
 
 		 705 aa  107  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  32.29 
 
 		 475 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  43.97 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.02 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.02 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  38.83 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  43.97 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  42.18 
 
 		 432 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  39.61 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  33.2 
 
 		 419 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  40.6 
 
 		 498 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  38.96 
 
 		 398 aa  98.6  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  32.92 
 
 		 420 aa  98.2  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.02 
 
 		 390 aa  98.2  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  30.38 
 
 		 911 aa  98.2  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  36.61 
 
 		 418 aa  97.4  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.74 
 
 		 562 aa  97.4  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.57 
 
 		 545 aa  97.8  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.33 
 
 		 435 aa  97.8  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  29.67 
 
 		 413 aa  97.4  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  42.57 
 
 		 419 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  29.7 
 
 		 441 aa  96.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.16 
 
 		 525 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  32.07 
 
 		 394 aa  96.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 		 417 aa  95.9  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  33.06 
 
 		 414 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  33.46 
 
 		 414 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  33.46 
 
 		 414 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  33.46 
 
 		 414 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  36.98 
 
 		 411 aa  95.1  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.04 
 
 		 454 aa  94.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  33.2 
 
 		 428 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  37.86 
 
 		 433 aa  94.4  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  37.5 
 
 		 564 aa  94.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  29.24 
 
 		 408 aa  94  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  38.1 
 
 		 851 aa  93.6  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  31.06 
 
 		 404 aa  93.6  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.06 
 
 		 513 aa  93.6  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  29.41 
 
 		 442 aa  93.6  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  39.52 
 
 		 501 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  31.49 
 
 		 410 aa  93.2  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.54 
 
 		 413 aa  93.2  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  38.16 
 
 		 623 aa  93.6  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  27.8 
 
 		 417 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.33 
 
 		 397 aa  92.4  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  38.16 
 
 		 750 aa  92.8  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  36.7 
 
 		 419 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  31.25 
 
 		 402 aa  91.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.23 
 
 		 430 aa  91.3  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  29.05 
 
 		 718 aa  91.3  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0143  putative flagellar hook protein FlgE  32.79 
 
 		 503 aa  90.9  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  30.8 
 
 		 404 aa  90.5  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.91 
 
 		 462 aa  90.5  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  30.64 
 
 		 401 aa  90.1  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  30.47 
 
 		 402 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  38.71 
 
 		 527 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  30.47 
 
 		 402 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  35.2 
 
 		 426 aa  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.04 
 
 		 423 aa  89.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.65 
 
 		 501 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.431038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  33.74 
 
 		 398 aa  89.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  32.65 
 
 		 409 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  31.45 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  32.52 
 
 		 413 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  31.45 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  31.45 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  37.21 
 
 		 399 aa  88.6  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2731  hypothetical protein  30 
 
 		 501 aa  88.6  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000961084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  32.07 
 
 		 418 aa  88.6  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  34.9 
 
 		 408 aa  88.2  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.65 
 
 		 395 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  30.34 
 
 		 401 aa  87.8  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  28.4 
 
 		 770 aa  87.4  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>