More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5543 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  903    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  56.5 
 
 
460 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  57.76 
 
 
460 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  56.93 
 
 
460 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  54.08 
 
 
456 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  54.94 
 
 
456 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  49.9 
 
 
464 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  48.84 
 
 
466 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  39.91 
 
 
454 aa  309  9e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  48.97 
 
 
615 aa  208  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  47.97 
 
 
601 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  48.15 
 
 
613 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  54.92 
 
 
598 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  53.37 
 
 
598 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  54.92 
 
 
599 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  52.85 
 
 
610 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  32.78 
 
 
425 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  32.51 
 
 
421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  32.99 
 
 
421 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.9 
 
 
428 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  30.06 
 
 
410 aa  149  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.9 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  31.63 
 
 
426 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  31.03 
 
 
461 aa  143  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  29.79 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.8 
 
 
400 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  30.37 
 
 
400 aa  140  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  30.66 
 
 
419 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  31.42 
 
 
419 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  32.07 
 
 
410 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  32.43 
 
 
419 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  31 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  29.23 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  31.61 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  29.35 
 
 
404 aa  136  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  29.09 
 
 
413 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  29.71 
 
 
430 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  30.39 
 
 
430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  29.65 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  27.86 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  27.08 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  28.54 
 
 
425 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  26.87 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  28.31 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  30.36 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  29.79 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  31.56 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  29.38 
 
 
409 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1843  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.85 
 
 
273 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.71 
 
 
488 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.46 
 
 
462 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  26.75 
 
 
417 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  28.54 
 
 
405 aa  124  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  29.46 
 
 
413 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  29.44 
 
 
413 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  29.44 
 
 
413 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  29.44 
 
 
413 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.54 
 
 
435 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3689  hypothetical protein  48.51 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.59 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  29.29 
 
 
414 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  28.39 
 
 
398 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  29.29 
 
 
414 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  29.29 
 
 
414 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  27.83 
 
 
496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  29.05 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  28.24 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  29.42 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  26.26 
 
 
453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  28.98 
 
 
402 aa  118  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  28.24 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  29.08 
 
 
460 aa  117  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.63 
 
 
413 aa  117  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  26.31 
 
 
441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  27.89 
 
 
413 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  28.45 
 
 
418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  26.05 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  26.37 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  25.26 
 
 
394 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  25.99 
 
 
460 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  29.6 
 
 
433 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  29.84 
 
 
446 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  27.01 
 
 
450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  28.9 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3444  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.97 
 
 
569 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  27.18 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  27.18 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.03 
 
 
423 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.97 
 
 
397 aa  113  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  26.49 
 
 
437 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  26.84 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  28.33 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>