More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0913 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  93.04 
 
 		 460 aa  849    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  99.35 
 
 		 460 aa  903    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 460 aa  910    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  61.61 
 
 		 456 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  59.44 
 
 		 456 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  56.93 
 
 		 461 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  50.85 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  46.84 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  44.11 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  44.92 
 
 		 601 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  46.99 
 
 		 615 aa  212  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  47.39 
 
 		 613 aa  210  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  48.43 
 
 		 610 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  47.64 
 
 		 599 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.46 
 
 		 598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  48.57 
 
 		 598 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.17 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.17 
 
 		 428 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  33.06 
 
 		 421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  31.76 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  32.99 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  33.48 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.7 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  31.16 
 
 		 419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  31.92 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  31.24 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  29.26 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.06 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  29.94 
 
 		 426 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  29.22 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  29.11 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  29.6 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  29.25 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  29.75 
 
 		 419 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  29.91 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  28.93 
 
 		 402 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  29.46 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  28.18 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  30.69 
 
 		 419 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  28.39 
 
 		 413 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  29.81 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  31.77 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  30 
 
 		 401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  29.82 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  30.06 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.08 
 
 		 423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  31.57 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.77 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  29.44 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  28.73 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  29.89 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  30.8 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  28.85 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  30.38 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  44.13 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  28.79 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  29.23 
 
 		 432 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  28.09 
 
 		 394 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  29.55 
 
 		 410 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  27.31 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.14 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  28.51 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  29.25 
 
 		 405 aa  126  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  31.36 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  28.75 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  30.17 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  29.19 
 
 		 383 aa  126  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  30.17 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  31.36 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  31.36 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  29.16 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  29.16 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  28.45 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.73 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  29.81 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  29.41 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  123  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3689  hypothetical protein  50.72 
 
 		 263 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  28.57 
 
 		 407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  30.57 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  30.67 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  28.75 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  26.12 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  26.12 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  30.25 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.48 
 
 		 397 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  28.43 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  29.37 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  29 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2431  hypothetical protein  30.13 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  30.02 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>