More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2431 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2431  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  886    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  29.52 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  30.43 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  28.89 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  28.98 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  30.26 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  30.37 
 
 		 394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  28.93 
 
 		 463 aa  130  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  28.95 
 
 		 402 aa  130  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  30.13 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  26.77 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  30.16 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  29.07 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  28.6 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  27.37 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  29.74 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  28.66 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.06 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  29.07 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  28.23 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.13 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  29.47 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  30.52 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  29.28 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  30.92 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  30.4 
 
 		 460 aa  120  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  28.63 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  26.1 
 
 		 407 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  30.28 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  29.93 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.54 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.76 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  27.61 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.87 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  27.79 
 
 		 407 aa  116  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  28.2 
 
 		 441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  28.85 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.6 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  27.63 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  27.44 
 
 		 454 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.26 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.33 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  27.72 
 
 		 519 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.03 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  29.26 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  28.41 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  29.26 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  28.26 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  27.21 
 
 		 450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  28.12 
 
 		 401 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.23 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  27.25 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  26.93 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  27.63 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  28.67 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.28 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  28.94 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  28.44 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  28.41 
 
 		 402 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  28.24 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.48 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  28.24 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  34.62 
 
 		 601 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  27.27 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  27.27 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  28.18 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  30.44 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  30 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  27.78 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  30.07 
 
 		 414 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  29.32 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  29.32 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  27.7 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  26.3 
 
 		 435 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  27.07 
 
 		 405 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  29.71 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  28.01 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  28.14 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  29.71 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  29.71 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  29.62 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  29.71 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  28.01 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  29.71 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  28.01 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  29.71 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  29.15 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  26.13 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  26.13 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  27.19 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  29.71 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  29.28 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  29.19 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  28.31 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  27.79 
 
 		 461 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  28.74 
 
 		 395 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  28.96 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  28.96 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  27.23 
 
 		 461 aa  99.8  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>