More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1769 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  48.7 
 
 
819 aa  796    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
911 aa  1835    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  54.73 
 
 
814 aa  478  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  52.41 
 
 
851 aa  444  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  44.89 
 
 
814 aa  371  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  41.57 
 
 
838 aa  355  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  40.07 
 
 
845 aa  349  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  50.27 
 
 
875 aa  342  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  44.18 
 
 
718 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  47.69 
 
 
623 aa  184  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  53.19 
 
 
398 aa  181  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  51.08 
 
 
750 aa  179  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  46.38 
 
 
417 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  48.15 
 
 
702 aa  160  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.06 
 
 
488 aa  159  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  39.38 
 
 
441 aa  159  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  46.73 
 
 
519 aa  157  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  48.63 
 
 
463 aa  156  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  45.92 
 
 
440 aa  152  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  45.99 
 
 
394 aa  151  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  44.62 
 
 
705 aa  151  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.39 
 
 
390 aa  147  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  40.64 
 
 
408 aa  147  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.5 
 
 
508 aa  147  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.69 
 
 
428 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.69 
 
 
428 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  43.55 
 
 
770 aa  144  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.13 
 
 
454 aa  142  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  37.45 
 
 
419 aa  142  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  37.01 
 
 
419 aa  142  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.29 
 
 
636 aa  141  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.89 
 
 
462 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.85 
 
 
397 aa  135  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  41.53 
 
 
442 aa  135  3.9999999999999996e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  40 
 
 
479 aa  134  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  40.96 
 
 
475 aa  134  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  37.1 
 
 
428 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2049  hypothetical protein  34.26 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.49 
 
 
562 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.98 
 
 
276 aa  131  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  35.34 
 
 
407 aa  130  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  32.66 
 
 
410 aa  127  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  34.76 
 
 
399 aa  127  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  33.61 
 
 
383 aa  127  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.75 
 
 
584 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.59 
 
 
501 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  35.34 
 
 
417 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  32.93 
 
 
428 aa  125  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  32.93 
 
 
428 aa  125  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  32.93 
 
 
428 aa  125  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  34.8 
 
 
637 aa  125  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  32.82 
 
 
451 aa  124  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  34.73 
 
 
402 aa  124  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  34.73 
 
 
402 aa  124  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  34.73 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  34.83 
 
 
437 aa  123  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  45.65 
 
 
265 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  33.46 
 
 
405 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  29.36 
 
 
405 aa  122  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  34.73 
 
 
402 aa  122  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  44.2 
 
 
264 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.87 
 
 
513 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  34.44 
 
 
404 aa  122  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.12 
 
 
808 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0008  flagellar hook protein  32.94 
 
 
546 aa  122  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 
401 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  46.32 
 
 
564 aa  121  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  35.29 
 
 
401 aa  120  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 
401 aa  120  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  34.83 
 
 
437 aa  120  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  33.61 
 
 
408 aa  120  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  46.32 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  47.79 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 
405 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  34.6 
 
 
401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  35.12 
 
 
401 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  30.9 
 
 
496 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  43.71 
 
 
856 aa  119  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  35.83 
 
 
402 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  35.83 
 
 
402 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.32 
 
 
545 aa  119  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  41.76 
 
 
266 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  34.45 
 
 
399 aa  119  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  50.35 
 
 
275 aa  118  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  47.1 
 
 
261 aa  118  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.69 
 
 
426 aa  118  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  33.75 
 
 
403 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.85 
 
 
423 aa  117  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  33.75 
 
 
403 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  44.85 
 
 
262 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  38 
 
 
527 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  34.58 
 
 
403 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  36.7 
 
 
405 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  32.1 
 
 
804 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  34.58 
 
 
403 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  34.58 
 
 
403 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2428  flagellar basal body rod protein FlgG  34.38 
 
 
260 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.755764 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.31 
 
 
415 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.65 
 
 
266 aa  115  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1520  flagellar hook protein FlgE  33.2 
 
 
541 aa  115  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>