More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1520 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1520  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 541 aa  1087    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0042  flagellar hook protein  53.76 
 
 		 545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0081  flagellar hook protein  53.76 
 
 		 545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0058  flagellar hook protein  52.84 
 
 		 545 aa  551  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0008  flagellar hook protein  39.42 
 
 		 546 aa  381  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2290  fagellar hook-basal body protein  35.02 
 
 		 567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2049  hypothetical protein  36.46 
 
 		 533 aa  277  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0031  hypothetical protein  34.92 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.16 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  27.43 
 
 		 479 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.27 
 
 		 513 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  27.73 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  26.95 
 
 		 519 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  33.2 
 
 		 911 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  31.33 
 
 		 814 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  25.98 
 
 		 501 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.431038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  26.15 
 
 		 440 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  37.7 
 
 		 851 aa  106  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 261 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  42.96 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 		 819 aa  105  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  27.06 
 
 		 464 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  30.63 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  32.75 
 
 		 770 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  33.85 
 
 		 718 aa  99.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  40.79 
 
 		 275 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  42.19 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  40.62 
 
 		 702 aa  98.2  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  38.2 
 
 		 814 aa  97.4  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.52 
 
 		 508 aa  97.1  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  32.7 
 
 		 398 aa  97.1  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.8 
 
 		 636 aa  96.3  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  32.08 
 
 		 705 aa  94.4  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.6 
 
 		 808 aa  94  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.33 
 
 		 462 aa  94  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.77 
 
 		 428 aa  93.6  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.71 
 
 		 397 aa  93.2  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  35.79 
 
 		 845 aa  92.8  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0803  flagellar basal body rod protein FlgG  36.62 
 
 		 265 aa  92.4  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.8 
 
 		 390 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.6 
 
 		 454 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.06 
 
 		 415 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  39.52 
 
 		 408 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  35.26 
 
 		 838 aa  91.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  37.37 
 
 		 875 aa  90.9  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  43.75 
 
 		 409 aa  91.3  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.52 
 
 		 525 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1103  flagellar basal body rod protein FlgG  34.17 
 
 		 262 aa  90.5  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1007  flagellar basal body rod protein FlgG  39.42 
 
 		 264 aa  90.1  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  30.48 
 
 		 401 aa  90.5  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.46 
 
 		 501 aa  90.1  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  39.69 
 
 		 498 aa  90.1  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.13 
 
 		 428 aa  90.1  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  32.18 
 
 		 262 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  36.05 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.4 
 
 		 499 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  39.2 
 
 		 856 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  35.48 
 
 		 410 aa  89.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  35.77 
 
 		 420 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  39.83 
 
 		 282 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  30.95 
 
 		 750 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  35.97 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  35.94 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  35.14 
 
 		 501 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  36.22 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  32.18 
 
 		 262 aa  88.2  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0546  hypothetical protein  32.83 
 
 		 661 aa  88.2  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  34.64 
 
 		 266 aa  87.8  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  36.5 
 
 		 262 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  32.46 
 
 		 402 aa  87.8  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.11 
 
 		 562 aa  87.4  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  32.46 
 
 		 402 aa  87.8  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  36.77 
 
 		 428 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  37.41 
 
 		 417 aa  87.8  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  39.2 
 
 		 623 aa  87.4  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  36.5 
 
 		 262 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  37.9 
 
 		 475 aa  87.4  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  40.14 
 
 		 264 aa  87.4  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.85 
 
 		 262 aa  87  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  38.28 
 
 		 404 aa  86.7  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2347  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.27 
 
 		 264 aa  86.7  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  33.83 
 
 		 266 aa  87  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 		 442 aa  86.7  9e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  34.96 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1156  flagellar basal body rod protein FlgG  36.09 
 
 		 261 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  37.24 
 
 		 265 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  34.96 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0523  flagellar basal body rod protein FlgG  37.33 
 
 		 262 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00648555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.1 
 
 		 435 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  40.8 
 
 		 564 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  34.96 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2278  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.81 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345323  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.58 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  38.4 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  34.68 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  31.34 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2184  flagellar basal body rod protein FlgG  37.59 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.012527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.25 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1010  hypothetical protein  41.27 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819939  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.96 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>