More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2278 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2278  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 395 aa  790    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345323  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0060  protein of unknown function DUF1078-like protein  35.5 
 
 		 392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  33.73 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.72 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  33.66 
 
 		 394 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.54 
 
 		 413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  30.75 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.47 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  32.08 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  31.82 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  31.34 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.5 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  30.48 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  31.22 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  32.7 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  30.66 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  31.68 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  31.88 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  31.88 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  29.4 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  31.6 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  29.57 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  31.29 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  31.29 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  32.7 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  27.96 
 
 		 475 aa  149  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  32.15 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  32.15 
 
 		 413 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  32.15 
 
 		 413 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  30.97 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.98 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  31.46 
 
 		 419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  28.45 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  28.88 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.02 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  31.55 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  31.08 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.83 
 
 		 462 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  30.77 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  30.05 
 
 		 383 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  31.21 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  29.2 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  29.95 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  30.07 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  29.9 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  29.9 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  29.5 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  29.68 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  28.37 
 
 		 413 aa  139  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  29.55 
 
 		 413 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  30 
 
 		 395 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  29.78 
 
 		 418 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  29.65 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  29.65 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  31.57 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  29.98 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  29.78 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  29.78 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  28.48 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  29.44 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.3 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  30.68 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  29.44 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  28.81 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  28.81 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  29.44 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  28.81 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  28.81 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  28.81 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  28.81 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  28.88 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  28.81 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  28.06 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  28.54 
 
 		 407 aa  136  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  30.79 
 
 		 407 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  28.31 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.03 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.03 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  28.64 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  28.64 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  28.64 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  28.88 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  28.88 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  27.46 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  28.88 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  27.46 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  27.46 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4674  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.47 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  28.99 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  27.63 
 
 		 413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  28.19 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.13 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  30.07 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  28.17 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  28.13 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.78 
 
 		 501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.52 
 
 		 395 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.44 
 
 		 418 aa  126  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  27.21 
 
 		 443 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  31.14 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>