More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1293 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  59.13 
 
 		 770 aa  873    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  100 
 
 		 705 aa  1402    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  46.54 
 
 		 750 aa  598  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  47.88 
 
 		 623 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  41.24 
 
 		 702 aa  210  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  50.8 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  49.73 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  28.51 
 
 		 637 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  36.8 
 
 		 394 aa  170  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.26 
 
 		 636 aa  165  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  46.45 
 
 		 441 aa  162  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  45.95 
 
 		 398 aa  161  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  39.08 
 
 		 440 aa  160  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.56 
 
 		 508 aa  160  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  35.48 
 
 		 475 aa  159  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  35.71 
 
 		 408 aa  157  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  44.71 
 
 		 838 aa  157  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  52.41 
 
 		 390 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  44.62 
 
 		 845 aa  153  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.16 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  44.62 
 
 		 911 aa  150  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  44.62 
 
 		 875 aa  150  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  44.09 
 
 		 814 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  38.7 
 
 		 851 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  43.16 
 
 		 718 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  31.78 
 
 		 819 aa  147  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  44.44 
 
 		 519 aa  145  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.32 
 
 		 488 aa  144  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  50.34 
 
 		 462 aa  144  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  44.09 
 
 		 814 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.22 
 
 		 397 aa  141  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  32.96 
 
 		 399 aa  141  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  42.16 
 
 		 417 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  34.67 
 
 		 442 aa  136  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  50.35 
 
 		 426 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  35.04 
 
 		 410 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.39 
 
 		 276 aa  135  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  33.82 
 
 		 410 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 419 aa  133  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  34.36 
 
 		 419 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  32.96 
 
 		 383 aa  130  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  35.41 
 
 		 405 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  34.88 
 
 		 417 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  36.94 
 
 		 409 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  49.64 
 
 		 264 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  29.95 
 
 		 405 aa  128  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.59 
 
 		 428 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.59 
 
 		 428 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  32.43 
 
 		 804 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  49.61 
 
 		 265 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.22 
 
 		 415 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  37.78 
 
 		 413 aa  127  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  37.78 
 
 		 413 aa  127  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  37.78 
 
 		 413 aa  127  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  37.78 
 
 		 413 aa  127  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  37.78 
 
 		 413 aa  127  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  37.78 
 
 		 413 aa  127  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  35.29 
 
 		 404 aa  127  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  37.78 
 
 		 413 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  36.43 
 
 		 414 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1399  fagellar hook-basal body protein  45.95 
 
 		 335 aa  126  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  33.95 
 
 		 407 aa  126  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  36.96 
 
 		 413 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  32.14 
 
 		 428 aa  126  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  32.14 
 
 		 428 aa  126  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  32.14 
 
 		 428 aa  126  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  33.93 
 
 		 408 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  33.21 
 
 		 387 aa  125  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  34.81 
 
 		 414 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  34.81 
 
 		 414 aa  124  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  34.81 
 
 		 414 aa  124  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 		 413 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  34.93 
 
 		 413 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  46.88 
 
 		 275 aa  123  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  35.66 
 
 		 413 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  35.66 
 
 		 413 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  36.1 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.83 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  34.68 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.41 
 
 		 435 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  29.21 
 
 		 453 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  33.21 
 
 		 433 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  32.43 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  33.59 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.11 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  34.88 
 
 		 418 aa  120  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.89 
 
 		 431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1570  flagellar hook protein FlgE  31.4 
 
 		 407 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.370708  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  32.95 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  32.43 
 
 		 425 aa  119  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  32.95 
 
 		 405 aa  119  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  50.86 
 
 		 282 aa  119  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  32.95 
 
 		 437 aa  118  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  32.21 
 
 		 425 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  33.09 
 
 		 401 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  32.95 
 
 		 405 aa  117  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  36.15 
 
 		 406 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  33.2 
 
 		 401 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.39 
 
 		 545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>