More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1975 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  100 
 
 
387 aa  764    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  53.75 
 
 
383 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  42.96 
 
 
404 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  43.07 
 
 
399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  43.46 
 
 
401 aa  278  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  39.81 
 
 
410 aa  278  9e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  42.33 
 
 
402 aa  275  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  42.33 
 
 
402 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  42.48 
 
 
405 aa  275  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  40.63 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  43.07 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  42.96 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  41.98 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  41.98 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  41.98 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  42.96 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  42.08 
 
 
402 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  42.08 
 
 
402 aa  272  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  39.56 
 
 
407 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  39.56 
 
 
407 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  39.71 
 
 
408 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  43.9 
 
 
404 aa  269  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  41.98 
 
 
403 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  41.98 
 
 
403 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  40.53 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  41.36 
 
 
405 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  40.6 
 
 
428 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  40.6 
 
 
428 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  40.6 
 
 
428 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  41.28 
 
 
406 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  42.2 
 
 
407 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  38.57 
 
 
417 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  39.56 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  39.23 
 
 
410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  39.8 
 
 
405 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  38.98 
 
 
413 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  38.98 
 
 
413 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  38.98 
 
 
413 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.41 
 
 
430 aa  252  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  39.37 
 
 
413 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  39.76 
 
 
418 aa  249  9e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  38.04 
 
 
414 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  36.57 
 
 
442 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  37.47 
 
 
415 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  38.04 
 
 
414 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  38.04 
 
 
414 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  38.8 
 
 
413 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  39.35 
 
 
425 aa  246  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  39.85 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  37.56 
 
 
414 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  37.3 
 
 
413 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  37.77 
 
 
420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  37.53 
 
 
413 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  38.93 
 
 
425 aa  242  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  37.56 
 
 
413 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  37.56 
 
 
413 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  37.56 
 
 
413 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  37.56 
 
 
413 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  37.56 
 
 
413 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  37.56 
 
 
413 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  37.56 
 
 
413 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  40.48 
 
 
414 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  36.98 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  37.96 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  37.96 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  38.65 
 
 
400 aa  232  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.19 
 
 
400 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  37.07 
 
 
401 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  38.26 
 
 
413 aa  229  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.66 
 
 
426 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  36.92 
 
 
404 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.17 
 
 
418 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  35.46 
 
 
453 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  34.91 
 
 
437 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  36.91 
 
 
398 aa  223  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  34.13 
 
 
462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  34.46 
 
 
437 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  34.99 
 
 
461 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  35.38 
 
 
453 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  34.09 
 
 
438 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  34.51 
 
 
454 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  37.16 
 
 
399 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.32 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  34.2 
 
 
460 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  37.22 
 
 
402 aa  216  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.39 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  34.65 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  34.65 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  34.35 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  33.26 
 
 
450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  34.65 
 
 
453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  36.72 
 
 
398 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  32.46 
 
 
455 aa  210  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  34.84 
 
 
440 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  33.48 
 
 
453 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 
453 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 
453 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 
453 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  33.05 
 
 
462 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  33.48 
 
 
453 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.260211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>