91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1228 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  94.81 
 
 		 367 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 367 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  72.21 
 
 		 367 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  69.51 
 
 		 364 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  64.35 
 
 		 361 aa  424  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  59.01 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  60.29 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  60.29 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  50.14 
 
 		 358 aa  336  5e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  49.15 
 
 		 363 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  50.15 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  48.17 
 
 		 389 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  48.81 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  51.21 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  49.39 
 
 		 370 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  48.02 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  48.45 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  47.86 
 
 		 359 aa  269  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  48.09 
 
 		 359 aa  268  8e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  49.39 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  44.57 
 
 		 344 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  42.5 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  47.9 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  45.87 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  47.46 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  42.34 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  44.57 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  44.04 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  43.56 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  45.77 
 
 		 381 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  48.52 
 
 		 360 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  36 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.84 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  37.5 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  43.3 
 
 		 383 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  40.97 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  40.53 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  42.01 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  40.7 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  40.99 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  40.43 
 
 		 422 aa  206  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  38.42 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  39.53 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  39.6 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  36.93 
 
 		 452 aa  202  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  37.04 
 
 		 441 aa  195  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  37.27 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  40.18 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  41.67 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  38.46 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.64 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  38.24 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  33.24 
 
 		 358 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  26.05 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.76 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.2 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  24.92 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  25.96 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  26.84 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  26.97 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  26.43 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  27.31 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  26.56 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  24.29 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  25.76 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  26.79 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  27.35 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  27.89 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  28.07 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  28.07 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  23.93 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  24.63 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  26.25 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  24.22 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  24.01 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  25.89 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  26.54 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  24.39 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  25.6 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  25.3 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  28.51 
 
 		 307 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  23.64 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  24.39 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  26.05 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  30.58 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  29.35 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  26.75 
 
 		 313 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  30.3 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  30.3 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  25.1 
 
 		 311 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>