72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3097 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 370 aa  721    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  82.35 
 
 		 365 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  79.08 
 
 		 362 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  72.73 
 
 		 362 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  66.76 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  68.99 
 
 		 360 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  68.7 
 
 		 362 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  58.04 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  50.91 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  49.39 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  53.42 
 
 		 361 aa  295  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  50.31 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  48.77 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  52 
 
 		 344 aa  285  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  47.89 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  46.77 
 
 		 357 aa  275  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  49.11 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  49.85 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  49.55 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  44.07 
 
 		 341 aa  262  6.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  47.35 
 
 		 359 aa  262  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  43.66 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  48.38 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  44.98 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  47.18 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  47.38 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  47.38 
 
 		 358 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  48.38 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  46.18 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  46.18 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  46.96 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  46.67 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  42.81 
 
 		 355 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  44.34 
 
 		 383 aa  229  8e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  36.9 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  45.8 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  37.33 
 
 		 422 aa  222  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  39.77 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  49.81 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  48.68 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  37.85 
 
 		 350 aa  218  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  41.52 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.14 
 
 		 325 aa  210  4e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  38.95 
 
 		 480 aa  209  6e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  39.83 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  40.12 
 
 		 367 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  39.55 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  39.94 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  37.01 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  35.91 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  41.54 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.73 
 
 		 344 aa  179  8e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  33.84 
 
 		 358 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  23.78 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  27.25 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  25.81 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  24.16 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  28.12 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.96 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  24.13 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.62 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  23.05 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  28.97 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  24.77 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  21.41 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  28.28 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  28.1 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  25.14 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  23.71 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  28.97 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.76 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  45.28 
 
 		 307 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>