79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3831 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  98.98 
 
 		 391 aa  757    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  89.51 
 
 		 391 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  100 
 
 		 391 aa  763    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  57.47 
 
 		 381 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  60.88 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  55.7 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  52.74 
 
 		 379 aa  332  8e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  46.22 
 
 		 370 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  43.11 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  46.36 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  44.12 
 
 		 389 aa  245  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  44.76 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  40.06 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  43.96 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  41.31 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  43.53 
 
 		 360 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  44.82 
 
 		 365 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  42.86 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  39.53 
 
 		 367 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  43.24 
 
 		 362 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  39.44 
 
 		 357 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  41.64 
 
 		 361 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  38.95 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  37.84 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  42.56 
 
 		 343 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  40.9 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  44.38 
 
 		 355 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  36.49 
 
 		 422 aa  212  7.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  38.87 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.67 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  42.78 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  43.73 
 
 		 360 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  40.06 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  40.06 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  41.71 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  40.86 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  43.64 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  33.52 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  42.18 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  40.41 
 
 		 350 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  42.34 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  44.7 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  36.67 
 
 		 349 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  36.49 
 
 		 362 aa  188  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  36.24 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  42.58 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  36.78 
 
 		 480 aa  177  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  34.06 
 
 		 452 aa  176  9e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  33.43 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  33.93 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  32.71 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.44 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  32.86 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  27.6 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  27.8 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  26.39 
 
 		 339 aa  57  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  28.07 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  28.22 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  21.96 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  27.9 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  25.51 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  28.26 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  24.34 
 
 		 335 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  24.65 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  26.74 
 
 		 363 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 		 341 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  26.32 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  25.58 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  24.65 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  24.65 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  24.38 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  24.38 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  24.65 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.74 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  24.38 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  24.38 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  24.71 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  26.48 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  28.16 
 
 		 311 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>