113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4596 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 380 aa  738    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  54.95 
 
 		 355 aa  312  6.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  48.32 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  44.04 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  48.64 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  43.24 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  46.29 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  42.13 
 
 		 367 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  47.77 
 
 		 370 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  47.16 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  43.24 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  41.57 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  46.69 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  43.06 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  49.22 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  45.65 
 
 		 359 aa  229  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  48.9 
 
 		 361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  45.53 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  46.32 
 
 		 363 aa  222  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  42.02 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  45.97 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  42.64 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  38.59 
 
 		 422 aa  217  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  46.65 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  39.22 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  43.49 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  38.84 
 
 		 358 aa  206  7e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  42.03 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  41.38 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  39.84 
 
 		 480 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  36.75 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  44.83 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  44.83 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  36.22 
 
 		 325 aa  195  9e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  35.56 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  44.9 
 
 		 367 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  40.29 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  43.79 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  38.89 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  36.36 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  44.15 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  42.86 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  40.18 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  36.66 
 
 		 441 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  44.61 
 
 		 382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  43.11 
 
 		 382 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  36.8 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  35.03 
 
 		 347 aa  163  6e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  37 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  32.62 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  42.6 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  33.03 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  32.93 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  26.88 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  26.59 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.62 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  29.44 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  27.78 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  23.62 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  27.16 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  26.82 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  28.76 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  26.26 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  28.02 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  23.48 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  23.73 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  26.26 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  26.17 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  31.43 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  26.56 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  25.54 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  25.39 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  27.92 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  25.46 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  24.45 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  24.45 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  24.06 
 
 		 327 aa  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  24.09 
 
 		 325 aa  49.7  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  25.69 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  25.69 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  25.69 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  25.69 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  28.31 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  30.19 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  24.63 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  24.12 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  25.38 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  23.15 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  25.38 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  26.15 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  25.13 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  27.64 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  29.67 
 
 		 304 aa  47  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  24.19 
 
 		 325 aa  47  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  26.44 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  25.38 
 
 		 369 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  24.62 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  28.57 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  28.57 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  21.58 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>