95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5367 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 360 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  87.61 
 
 		 360 aa  524  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  70.26 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  67.42 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  65.74 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  66.02 
 
 		 382 aa  360  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  57.49 
 
 		 363 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  51.18 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  51.82 
 
 		 389 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  49.71 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  57.59 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  52.99 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  52.99 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  53.06 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  51.37 
 
 		 362 aa  295  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  54.68 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  51.19 
 
 		 367 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  53.69 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  48.99 
 
 		 367 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  48.82 
 
 		 367 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  50.61 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  48.97 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  43.79 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  47.25 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  51.37 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  52.12 
 
 		 365 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  52.17 
 
 		 362 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  45.11 
 
 		 381 aa  239  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  44.51 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  45.06 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  39.3 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  41.39 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  46.94 
 
 		 343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  47.48 
 
 		 383 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  43.99 
 
 		 391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  43.99 
 
 		 391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  38.21 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  45.91 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  44.14 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  39.1 
 
 		 367 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  36.2 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  42.77 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  42.09 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  39.03 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  42.51 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  39.24 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  33.87 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  37.15 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  38.29 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  37.28 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  44.27 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  32.12 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  35.1 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.34 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.78 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.67 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  27.17 
 
 		 367 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  27.14 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  28.83 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  28.91 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  28.91 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  28.91 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  28.91 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  28.91 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  28.91 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  28.32 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  29.2 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  27.51 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  28.85 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  28.32 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  28.32 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  30.48 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  29.17 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.57 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  28.02 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  37.19 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  28.29 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  25.81 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  25.81 
 
 		 370 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  26.51 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  25.93 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  28.48 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  26.67 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  28.97 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1786  cytochrome oxidase assembly  28.75 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  22.26 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  28.15 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  25.51 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  28.15 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  24.39 
 
 		 339 aa  46.2  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  25.93 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  26.56 
 
 		 311 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  29.05 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  30.61 
 
 		 387 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>