96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1878 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 359 aa  699    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  66.95 
 
 		 359 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  49.42 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  48.73 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  51.8 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  52.84 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  48.09 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  48.25 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  52.58 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  50.14 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  50.59 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  50.15 
 
 		 362 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  49.55 
 
 		 367 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  48.82 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  54.25 
 
 		 360 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  49.26 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  49.55 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  52.24 
 
 		 367 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  47.58 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  44.88 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  49.71 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  51.28 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  50.29 
 
 		 382 aa  252  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  47.94 
 
 		 382 aa  252  8.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  47.94 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  57.59 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  44.48 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  42.25 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  43.73 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  43.1 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  42.99 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  42.09 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  46.43 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  46.9 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  44.89 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  37.32 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  40.46 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  40.17 
 
 		 391 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  38.42 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  39.2 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  37.73 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  39.32 
 
 		 391 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  38.94 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  39.03 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  36.54 
 
 		 452 aa  191  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  43.5 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  38.24 
 
 		 480 aa  185  9e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  36.59 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  36.92 
 
 		 367 aa  175  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  35.69 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  35.03 
 
 		 358 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  40.62 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.02 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.81 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.13 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  28.13 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.93 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  26.79 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  27.69 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  26.79 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  26.79 
 
 		 325 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  28.44 
 
 		 369 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  26.48 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  36.61 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  25.84 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  27.24 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  27.84 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  27.19 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  27.84 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  27.84 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  28.14 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  27.84 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  27.84 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  27.84 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  26.06 
 
 		 325 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  28.4 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  28.4 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  26.59 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  28.1 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  24.3 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  25 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  21.34 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  28.1 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  24.71 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  26.54 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  26.7 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  25.66 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  22.46 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  28.17 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  24.93 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  28.17 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  24.45 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  25.98 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  26.89 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  24.77 
 
 		 343 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  29.21 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>