82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1607 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1607  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 382 aa  732    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1888  cytochrome oxidase assembly  98.17 
 
 		 382 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1632  cytochrome oxidase assembly  91.34 
 
 		 381 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  74.37 
 
 		 367 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5863  cytochrome oxidase assembly  66.47 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5367  cytochrome oxidase assembly  66.02 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  56.25 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2460  cytochrome oxidase assembly  49.54 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2502  cytochrome oxidase assembly  49.7 
 
 		 357 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  48.18 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4601  putative cytochrome oxidase assembly protein  49.55 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3097  cytochrome oxidase assembly  48.39 
 
 		 370 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2687  cytochrome oxidase assembly  48.92 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0468581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1418  cytochrome oxidase assembly  48.13 
 
 		 360 aa  279  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0782  putative cytochrome c oxidase assembly protein  47.27 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0627  cytochrome oxidase assembly protein  43.95 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00536761  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  51.51 
 
 		 361 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0787  cytochrome c oxidase assembly protein, putative  49.4 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1878  cytochrome oxidase assembly  50.29 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  44.04 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0858  cytochrome oxidase assembly  48.02 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151768  normal  0.254409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0808  cytochrome oxidase assembly  48.58 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2665  cytochrome oxidase assembly  46.31 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.352051  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1316  cytochrome oxidase assembly  45.45 
 
 		 367 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2701  cytochrome oxidase assembly  47.02 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1519  cytochrome oxidase assembly  45.86 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.459506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2047  cytochrome oxidase assembly  41.87 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1335  cytochrome oxidase assembly  42.9 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1204  cytochrome oxidase assembly  46.98 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2927  cytochrome oxidase assembly  44.51 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548442  hitchhiker  0.000233387 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3699  cytochrome oxidase assembly  46.31 
 
 		 391 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2097  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0855  putative cytochrome oxidase assembly protein  39.64 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4907  cytochrome oxidase assembly  38.48 
 
 		 341 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1512  putative cytochrome oxidase assembly protein  44.66 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159721  normal  0.764722 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3831  putative cytochrome oxidase assembly factor  43.58 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.149666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3524  cytochrome oxidase assembly  43.14 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0432  cytochrome c oxidase assembly protein  39.06 
 
 		 350 aa  201  3e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.668345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0242  cytochrome oxidase assembly  41.71 
 
 		 355 aa  199  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177445  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3028  cytochrome oxidase assembly  43.67 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3812  carboxypeptidase Taq  42.73 
 
 		 391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0177967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0841  cytochrome oxidase assembly  39.93 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43606  predicted protein  36.61 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.953763 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01915  cytochrome c oxidase assembly protein cox15 (AFU_orthologue; AFUA_6G07670)  39 
 
 		 441 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0653735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4596  cytochrome oxidase assembly  43.43 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00720  cytochrome c oxidase biogenesis-related protein, putative  37.07 
 
 		 452 aa  182  6e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.564736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1225  cytochrome oxidase assembly  38.24 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21354  predicted protein  35.09 
 
 		 422 aa  179  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.875011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2432  cytochrome oxidase assembly  41.74 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.11345 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3288  cytochrome oxidase assembly  38.75 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84097  Cytochrome c oxidase assembly protein COX15  37.57 
 
 		 480 aa  176  7e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0709  cytochrome oxidase assembly  34.04 
 
 		 347 aa  168  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0294  putative cytochrome oxidase assembly protein  38.63 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1224  cytochrome oxidase assembly  34.4 
 
 		 358 aa  154  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.17 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.3 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  26.81 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  26.81 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  28.39 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  27.64 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  27.44 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  27.44 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  27.44 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  27.44 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  27.44 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  27.44 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  27.44 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  27.43 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  27.44 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  26.57 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  26.46 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  22.92 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  27.14 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  26.46 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  26.46 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  24.73 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  29.17 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  26.61 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  21.69 
 
 		 328 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  26.47 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  25.67 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  34.27 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  23.8 
 
 		 339 aa  43.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>