181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4285 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
341 aa  690    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  40.72 
 
 
311 aa  215  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  35.6 
 
 
342 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  34.1 
 
 
323 aa  169  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  32.15 
 
 
327 aa  155  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  33.23 
 
 
339 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  33.86 
 
 
326 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  32.83 
 
 
354 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  27.92 
 
 
343 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 
313 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  30.34 
 
 
313 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  32.48 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  29.33 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  34.01 
 
 
376 aa  77  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  26.73 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  26 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  29.33 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  27.42 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  33.8 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  28.87 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  31.39 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  37.14 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  37.14 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  37.14 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  37.14 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  28.38 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  28.15 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  28.67 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  36.43 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  28.05 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  36.43 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  36.43 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  36.43 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  25.66 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  27.08 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  30.64 
 
 
622 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  30.82 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  33.87 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  34.35 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  35.71 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  27.76 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  30.37 
 
 
361 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  26.22 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  28.83 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  33.1 
 
 
369 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  28.83 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  32.84 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  32.39 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  25.31 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  33.56 
 
 
370 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  35 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  28.96 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  23.31 
 
 
353 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  28.1 
 
 
319 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  30.25 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  28.08 
 
 
391 aa  62.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  34.35 
 
 
325 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  29.02 
 
 
342 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  34.35 
 
 
325 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  24.21 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  34.35 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  30.56 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  29.41 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  34.35 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  34.85 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  26.84 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  24.45 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  34.06 
 
 
370 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  29.02 
 
 
305 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  27.99 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  34.06 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  31.72 
 
 
369 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  26.44 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  26.97 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1786  cytochrome oxidase assembly  28.66 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  25.79 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  26.13 
 
 
351 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  32.65 
 
 
369 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  34.35 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  32.06 
 
 
325 aa  59.7  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  32.61 
 
 
370 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  29.89 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  32.82 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  32.82 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  28.99 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  31.43 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  32.05 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  33.86 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  31.78 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  27.97 
 
 
392 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  28.38 
 
 
364 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  28.72 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.33 
 
 
387 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  30.65 
 
 
298 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  33.33 
 
 
387 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  30.11 
 
 
506 aa  56.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  30.88 
 
 
383 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  30.89 
 
 
345 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>